脂肪酸代謝は、ミトコンドリア内で行なわれる。(合成は細胞液で行なう。)
直鎖脂肪酸は、カルボキシル基とα炭素が、アセチルCoAの形で外れ、炭素２個分ずつ短く分解される。
反応は、左に示す過程を経る。
β炭素の酸化が、反応の中心である事が分かる。
一サイクルの分解の過程(炭素２個が外れる過程)で、FADとNAD+が一分子ずつ生じる。
また、分解によって得られる２個の炭素は、アセチルCoAの形なので、これはTCA 回路に導入され、エネルギーを産生する。
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