El Manga de Card Captor Sakura se comenzó a publicarse en junio de 1996, por el Grupo Clamp, ya conocido por su famosa obra, Magic  Knight Rayearth (Las Guerreras Magicas). Se publicó en Nakayoshi, y  finalizó tres años después. El manga sólo cuenta con 12 tomos, y la  historia está dividida en dos partes, al igual que el anime: la primera es la captura de las cartas, en los seis primeros, y la  segunda es la transformación de ellas a Cartas Sakura, en los seis ultimos. Cada tomo viene con una carta de un personaje de la  historia. Un detalle importante, es que en el manga sólo existen 19 Cartas Clow, mientras que en el anime hay 52 cartas.

También hay diferencias a lo largo de la historia: personajes que en el anime existen y en el manga no (Meiling, Wei), explicaciones más detalladas, que en el anime no se entiende (como porque a Sakura le gusta Kaho y a Shaoran no, y a ambos les gusta Yukito), y un final distinto.

Actualmente, Editorial Ivrea está publicando el manga de Card Captor Sakura desde junio de 2001, y los números atrasados pueden conseguirse en cualquier comiquería de Argentina. En el mes de agosto del corriente año, salió a la venta el tomo número 11, por lo que en un mes podremos conseguir el último tomo.