Diego Mauricio Riano Pachon

Escritos y presentaciones


- ncRNas(PDF)
- Trabajo de grado: Caracterización Molecular, mediante Electroforesis en Gel por Campo Pulsado, de Aislamientos de Vibrio cholerae, Obtenidos en Colombia entre 1991 y 1996 (PDF)
- Genetic diversity and structure of the Vibrio cholerae population in Colombia (Publicado en español en la Revista Colombiana de Biotecnología Vol. 5 No. 1) (PDF)
- Una guía para el análisis de conglomerados (DOC|PPT).

Páginas desactualizadas

Astronomía Cladística EpiMol

Lecturas recomendadas

The Last question por Isaac Asimov

Tópicos Cubiertos

La parte que resta de este capítulo concierne a las definiciones de los términos básicos, las relaciones entre sistemática filogenética y otras áreas de biología comparada, y una introducción a la filosofía de la ciencia.

La mayor parte de este libro trata con la naturaleza de las especies (Capítulo 2) y taxa superiores (v.g., taxa supraespecíficos; Capítulo 3). Mi propósito es discutir extensivamente la especie, es desarrollar un concepto de especie biológicamente relevante que pueda ser aplicado fructíferamente a la filogenética, y explorar las implicaciones de este concepto en la teoría de la especiación, la biogeografía y los aspectos prácticos del reconocimiento de las especies. Los taxa supraespecíficos son tratados como el resultado natural de clasificar la historia de la especiación. El énfasis del Capítulo 3 es sobre el desarrollo del concepto del "taxón natural supraespecífico" y que tal taxón es monofilético en el sentido de Hennig (v.g., tal taxón incluye un ancestro y todos sus descendientes).

Luego desarrollaré los conceptos concernientes a las entidades relacionadas en los arboles filogenéticos, a su turno consideraré a los arboles mismos (Capítulo 4). El punto central de Capítulo 4 es la jerarquía de las relaciones organísmicas y de los arreglos de los arboles filogenéticos que podemos inferir de la observación de la naturaleza. Es importante entender como nuestros conceptos de entidades evolutivas afectan a los modelos (arboles) que podríamos percibir en la naturaleza. El capítulo 5 trata con los caracteres y como los caracteres pueden ser usados para probar un arreglo de arboles filogenéticos en competencia, para el mismo taxa. De particular interés están: (1) el establecimiento de un concepto de homología y (2) los métodos que pueden ser usados para determinar cual de los dos homólogos es una condición apomórfica (derivada) y cual es una condición plesiomórfica (primitiva). El final de capítulo tiene tres ejemplos de análisis filogenético completamente desarrollados y una consideración de ciertos algoritmos de ordenador como herramientas para la argumentación filogenética.

El Capítulo 6 trata de las clasificaciones filogenéticas. Se discuten las varias formas de construir una clasificación filogenética. Se detalla un sistema basado en la jerarquía Linneana. Uno de los mayores problemas para la filogenética ha sido la clasificación. El problema ha sido tanto práctico como teórico. El problema práctico ha sido la poca habilidad de los filogenetistas para convencer a algunas partes de la comunidad sistemática de que las clasificaciones filogenéticas rigurosas, son construcciones útiles. El énfasis del capítulo sexto se coloca sobre un sistema de convenciones que resulte en una clasificación filogenética simple y conveniente y sobre la demostración de la utilidad de tales clasificaciones.

El Capítulo 7 contiene críticas de dos de los tres acercamientos alternos al sistema filogenético: taxonomía evolutiva y fonética. No pretendo que este libro sea una consideración balanceada de uno u otro de esos acercamientos, como uno podría esperar de un texto que pretende inspeccionar desapasionadamente el campo entero de la sistemática. Así, el estudiante no debe esperar aprender como hacer fenética o taxonomía evolutiva. Más adelante este capítulo contiene las razones por las que Yo y otros rechazamos esos acercamientos.

El Capítulo 8 es una introducción a la biogeografía histórica. La biogeografía no es sistemática. Es más, la sistemática provee una serie de datos básicos para el biogeógrafo. Yo lo creo adecuado para discutir los varios acercamientos a la biogeografía histórica y esbozar cortamente un acercamiento que está muy ligado a la sistemática filogenética, la vicarianza biogeográfica.

Los capítulos 9 y 10 están dedicados a tratar serios asuntos prácticos en sistemática. El capítulo 9 comienza con una consideración de los especímenes. Los tópicos considerados incluyen la selección de especímenes, colección en campo y curación. En el Capítulo 10 se discuten varias clases de caracteres (v.g., morfológicos, bioquímicos, etc.). Yo enfatizo los caracteres no morfológicos porque muchos de los ejemplos previos conciernen a la morfología (especialmente en el Capítulo 5). Los ejemplos que muestran la aplicación filogenética de esas varias clases de caracteres al sistema filogenético son discutidos. El Capitulo 10 finaliza con una consideración del análisis cuantitativo de caracteres como una herramienta para la descripción básica y sumarización de los datos y como un instrumento para la discriminación de taxón y las interrelaciones de caracteres (varias técnicas multivariadas). Asumo una experiencia básica en estadística.

El Capítulo 11 está dirigido hacia la publicación sistemática y las tres mayores reglas de nomenclatura. Dos de los aspectos más importantes de la sistemática son un conocimiento previo de la literatura y la claridad de una publicación sistemática. Adicionalmente, la marca de un buen investigador taxonómico es la familiaridad con las reglas de nomenclatura que gobiernan varios aspectos de la historia nomenclatural del taxón o grupo de interés. Ya que este libro trata de la sistemática en general, se tratan las tres mayores claves (bacteriológica, botánica y zoológica), se discuten y contrastan.

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