Diego Mauricio Riaño Pachón

Escritos y presentaciones


- Orphan transcripts in Arabidopsis thaliana: identification of several hundred previously unrecognised genes. 2005. The Plant Journal.
- ncRNas(PDF)
- Trabajo de grado: Caracterización Molecular, mediante Electroforesis en Gel por Campo Pulsado, de Aislamientos de Vibrio cholerae, Obtenidos en Colombia entre 1991 y 1996 (PDF)
- Genetic diversity and structure of the Vibrio cholerae population in Colombia (Publicado en español en la Revista Colombiana de Biotecnología Vol. 5 No. 1) (PDF)
- Una guía para el análisis de conglomerados (DOC|PPT).

Páginas desactualizadas

Astronomía Cladística EpiMol

Lecturas recomendadas

The Last question por Isaac Asimov

¿Quién es Diego?

Soy Biólogo de  la Universidad Nacional de Colombia. Desarrollé mi trabajo de grado en el área de epidemiología molecular, bajo la dirección de la profesora Emilia María Valenzuela de Silva. El título del trabajo fue: Caracterización Molecular, Mediante Electroforesis en Gel por Campo Pulsado (PFGE), de Aislamientos de Vibrio cholerae, obtenidos en Colombia entre 1991 y 1996. Este trabajo fue llevado a cabo en el Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional.

Me empecé a interesar por el cuento de la informática por allá en 1993-1994, y por sugerencia de la profesora Indiana Bustos ingresé al la Unidad de Procesamiento de Información Biológica que hacia parte del departamento de Biología. Permanecí vínculado a este grupo durante lo que restaba de mi formación como biólogo (que fueron varios años). Allí entre otras funciones estuve a cargo del desarrollo del la primera página web del departamento y mas tarde de la primera página web de la Facultad de Ciencias, esta vez bajo la dirección del Profesor Emiiliano Barreto.
Mas tarde me vincularía (aproximadamente cuando iba a medio camino en la realización de mi tesis de pregrado) al naciente Grupo de Bioinformática del profesor Barreto. Grupo que en ese momento integrabamos apenas tres personas incluyendo al profesor.
El período en que estuve vínculado al grupo de bioinformática (03.2000 - 06.2002) fue decisivo para mi carrera profesional, adionalmente fue un período lleno de gratas experiencias. Allí puse en marcha el primer servidor de bioinformática del IBUN, el primer servidor de BLAST de acceso abierto a la comunidad universitaria, participé en el desarrollo de cursos de extensión y colaboré estrechamente en el diseño de la primera asignatura de bioinformática ofrecida a estudiantes de ciencias biológicas en la Universidad Nacional.
Para este entonces ya habia tomado la desición de hacer carrera en el bioinformática.

Todo esto, junto con otros factores, me llevo a Alemania en septiembre del 2002.
Desde entonces hago parte del grupo de investigación del Profesor Dr. Bernd Mueller-Roeber, en la Universidad de Potsdam.

Iniciando 2004 comenzé mi proyecto de doctorado bajo la dirección del Profesor Mueller-Roeber. Mi proyecto consiste en la búsqueda de de ncRNAs (RNAs no codificantes, estos RNAs no son traducidos sino que ejercen su función como RNA, por ejemplo los tRNA, rRNA, snoRNA, y muchos otros)en Arabidopsis thaliana, por el momento he encontrado algunos transcritos huérfanos (no han sido anotados previamente) que podrían ser ncRNAs. La información obtenida está disponible en AtoRNADB
Paralelamente estoy trabajando en la identifiacion por medios computacionales de todos los genes involucrados en la regulación de la transcripción en arroz. He creado una base de datos que espero sea útil para varios investigadores: Rice Transcription Factor Database (RiceTFDB)

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