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Programa de Trabajos Prácticos de Química
Biológica (Carrera de Farmacia)
Programa
analítico
Unidad 1. Estructura de macromoléculas:
Proteínas. Aminoácidos, enlace peptídico, estructura
primaria, secundaria y tridimensional. Análisis estructural:
comparación de secuencias y predicción de estructuras primaria
y secundaria. Motivos y dominios funcionales.
Desnaturalización. Agentes desnaturalizantes. Formas de medir
el estado nativo y el desnaturalizado. Proceso de plegamiento.
Polisacáridos: unidades monosacarídicas, enlace glicosídico.
Oligo y poliolisacáridos simples y complejos. Glicoproteínas y
glicolípidos. Acidos nucleicos. Nucleótidos y enlace
fosfodiéster. ADN y ARN. Doble hélice. Superenrollamiento.
Gradientes de densidad. Desnaturalización, Agentes
desnaturalizantes. Formas de medir el estado nativo y el
desnaturalizado. Temperatura de fusión: factores que la afectan
e importancia conceptual.
Unidad 2. Purificación de macromoléculas: Métodos de
lisis celular, solubilización concentración y separación.
Concepto de capacidad y resolución. Cromatografía de
exclusión molecular y de intercambio iónico. Cuantificación
de proteínas: absorbancia en UV y métodos colorimétricos.
Medidas de actividad enzimática. Análisis cuantitativo de la
purificación: rendimiento, recuperación, actividad específica
y factor de purificación. Criterios de evaluación. Análisis
cualitativo de la purificación: métodos de electroforesis
nativa y desnaturalizante.
Unidad 3. Enzimas. Estructura. Sitio
activo. Energía de activación. Cinética enzimática.
Análisis de Michaelis-Menten: concepto del equilibrio rápido y
del estado estacionario. Análisis de Haldane para enzimas
alostéricas. Efecto de los inhibidores, el pH y la temperatura
sobre la actividad enzimática. Cálculo de la energía de
activación. Regulación de la actividad enzimática.
Unidad 4. Metabolismo. Bioenergética.
Fuentes de carbono, nitrógeno, fósforo, azufre y otros
nutrientes en procariotas y eucariotas. Transporte. Ejemplos de
rutas catabólicas: glicolisis, ciclo de Krebs, cadena de
transporte electrónico. Ejemplos de rutas anabólicas: ciclo
del glioxilato, gluconeogénesis, síntesis de glucógeno en
procariotas y eucariotas. Producción y utilización de energía
y poder reductor. Regulación metabólica. Análisis del control
metabólico: conceptos de flujo metabólico, coeficientes de
control y elasticidad.
Unidad 5. Genética molecular.
Replicación del ADN. Transcripción del ADN a ARN. Promotores.
Enzimas y complejos multienzimáticos. Traducción: el código
genético, los ribosomas y la maquinaria de traducción.
Concepto de secuencias codificantes y no codificantes. Marcos de
lectura. Análisis de secuencias: señales de iniciación y
terminación de la transcripción y traducción. Intrones y
exones.
Unidad 6. Ingeniería genética: Enzimas
de restricción y vectores de clonado: características
principales y criterios de utilización. Construcción de
bibliotecas de cADN y de ADN genómico. Preparación y
utilización de sondas. Southern blots y Northern blots:
aplicaciones. Construcción de vectores recombinantes.
Transformación. Transducción. Selección. Reacción en cadena
de la polimerasa. Secuenciación. Automatización de estas
metodologías y análisis genómico.
Trabajos experimentales
Trabajo práctico 1. Purificación de b
-galactosidasa de Escherichia coli: preparación de cultivos,
lisis celular, precipitación con sulfato de amonio y
cromatografía de exclusión molecular y/o intercambio iónico.
Seguimiento de la purificación por medidas de actividad
enzimática. Cuantificación de la actividad total y las
proteínas totales. Electroforesis en gel de poliacrilamida
desnaturalizante-disociante. Exposición de resultados en
seminarios y preparación de un reporte técnico de la
purificación.
Trabajo práctico 2. Análisis cinético
de la b -galactosidasa de Escherichia
coli: obtención de los parámetros cinéticos Km y Vmax.
Análisis de inhibidores competitivos y no competitivos. Efecto
del pH sobre los parámetros cinéticos. Análisis de la
estabilidad de la enzima a distintas temperaturas.
Determinación de la energía de activación. Exposición de
resultados en seminarios y preparación de un reporte técnico
del estudio cinético.
Trabajo práctico 3. Síntesis de
glucógeno en Escherichia coli: preparación de cultivos en
distintos medios mínimos con o sin limitación de nitrógeno y
distintas fuentes de carbono. Análisis del efecto de la
limitación de nitrógeno y de la naturaleza de la fuente de
carbono sobre el crecimiento. Obtención de glucógeno.
Análisis estadístico del contenido de glucógeno en las
diferentes condiciones de crecimiento. observación del impacto
de la carga energética sobre la acumulación de glucógeno.
Exposición de resultados en seminarios y preparación de un
reporte técnico del estudio de la síntesis de glucógeno.
Trabajo práctico 4. Transformación de
Escherichia coli lac- en lac+. Preparación de células
competentes. Preparación de un plásmido conteniendo el gen
lacZ por lisis alcalina. Transformación. Selección de clones
lac+. Cálculo de la eficiencia de la transformación. Estudio
de la regulación de la expresión de lacZ en presencia de IPTG,
lactosa o glucosa en las bacterias transformadas y en las lac-.
Síntesis de glucógeno a partir de lactosa o glucosa en las
bacterias transformadas y en las lac-. Exposición de resultados
en seminarios y preparación de un reporte técnico sobre la
transformación.
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