Pasinler havzası dışa akışlı bir havzadır. Akaçlama alanından toplanan akarsular, bu ana akarsu tarafından, Çobandede köprüsünde Aras ırmağına katılmaktadır. Havzanın akarsular bakımından zengin bir bölge olduğu kabul edilmektedir.

Kuzeydeki akarsuların başlıcaları; Büyükdere, Müceldi, Tımar ve Miyadin dereleridir. Güneydeki dağlardan kaynaklanan dereler, uzun boylu olmalarına rağmen sularının bir kısmını fay hatlarında kaybettiklerinden, ovaya küçülerek ulaşırlar. Bu kısımdaki derelerin başlıcaları; Masat, Ecelin ve Nalbant dereleridir