Las apariciones de Nuestra Señora de todas las Gracias datan de hace 27 años, cuando la Santísima Virgen se apareció a un español de nombre José Jesús, en el pueblito de Entre Ríos en Sevilla, España.
Hace cinco años Nuestra Señora volvió a hablarle al vidente pidiéndole que se construyera un santuario en el Salvador,en un lugar que tuviera las siguientes particularidades: debía ser en un lugar cercano a las zonas de pobreza, en un sitio alto desde donde se ven tres iglesias.
El vidente español viajó al Salvador en busca del sitio descrito por Nuestra Señora y cuando ya casi perdía las esperanzas de encontrarlo fue llevado a una plantación de café cerca de El Salvador - en la frontera con Santa Tecla. Allí el vidente aprobó el sitio para la construcción y se levantó una capilla, una escuela y una clínica.