Choqekiraw encierra un simbolismo particularmente significativo. Para los pobladores de su región representa el último bastión de resistencia indígena durante la conquista; para los viajeros extranjeros del siglo XIX era parada obligatoria, a pesar de la enorme dificultad de acceso; para la flora y fauna del área es un santuario que alberga a diversas especies en vías de extinción.

Los pobladores locales,  los que viven en Abancay o en Curahuasi –en las riberas del río Apurímac  dicen que Choqekiraw era el lugar donde se habían refugiado los últimos incas que salieron del Cusco después de la derrota del último rey del Tawantinsuyu – Manco Inca, quienes resistieron durante cuatro décadas entre 1536 y 1572 –a los españoles, que ya se habían apoderado del Cusco, la capital del imperio.

Eso fue lo que escuchó Antonio Raimondi, el naturalista italiano que recorrió todo el Perú a mediados del siglo XIX, y ésa fue también la razón por la que este lugar despertó tanto interés en los viajeros que llegaban hasta esa región haciendo una larga y penosa travesía de varios días para alcanzar el paraje donde estaban las ruinas.

Lo que se veía entonces era muy poco: unos cuantos muros de tipo incaico, sin los bellos paramentos de estilo cusqueño, en medio de un bosque que lo cubría todo. El conde De Sartiges, aventurero francés de la época, fue a Choqekiraw en 1834.Luego de varios días de caminata, esperando hallar los supuestos tesoros que habrían dejado los incas de la resistencia, llegó al sitio con una gruesa compañía de campesinos locales e hizo lo que seguramente todos los viajeros hacían: cavar los pisos y romper paredes en busca de los tesoros.

Sin duda, si alguna vez hubo tesoros, éstos fueron expoliados desde el siglo XVI. En aquella época ya se conocían los asentamientos incaicos de la región, cuya riqueza en oro –y otros secretos se combinaba con el misterio que envolvía una clandestina y perdida capital de los incas rebeldes. Se conoce un documento de 1710 que menciona que “Chuquiquirao” es uno de cuatro “pueblos antiguos de la gentilidad” en la región de Vilcabamba –zona de refugio donde se instaló el gobierno de la resistencia –junto a Chuquitiray, Vilcabamba la Grande, habitación principal del Inga, y un pueblo de plateros del Inca. Todos ellos están mencionados en relación con el oro y la plata, y se afirma en el escrito levantado por don Juan Arias Díaz Topete que se comprobó y calificó...ser ciertas las noticias que por antiguas tradiciones se tenían de las riquezas de estos parajes.