Es importante la elección de la maceta que quieres ponerle a tu bonsai. Hay de muchas clases, calidades y precios. Tenemos la japonesa, que tiene siempre cuatro patas, la maceta coreana de tierra roja y muy bien esmaltada, la maceta europea, imitaciones más baratas, y la maceta china. Los recipientes mates, sin barniz, y con colores suaves son las mejores para los de hoja perenne y los recipientes esmaltados se utilizan principalmente para los caducifolios.
Según el grosor del tronco, la altura, el ancho y la profundidad hemos de poner una tamaño de maceta. Por ejemplo: La longitud de la maceta debe ser un poco más de los dos tercios de la altura del árbol. Si la altura del árbol es menor que su anchura, la longitud de la maceta se determina midiendo un poco más de dos tercios del ancho del árbol. La longitud de la maceta nunca debe ser la misma que la altura o el ancho del árbol. La profundidad de la maceta debe ser proporcional al tronco del árbol y finalmente el ancho de la maceta debe ser un poco menor que el ancho de las ramas, a ambos lados del árbol. 
La forma de la maceta debe estar relacionada al estilo, a la forma o al carácter del árbol. Por ejemplo los árboles con troncos curvados lucen mejor con una maceta ovalada, los de tronco recto se equilibran mejor con macetas rectangulares y los de gran porte con macetas grandes de aspecto similar. Algunos bonsai de hoja caduca pueden plantarse en macetas más grandes y profundas, porque requerirán más espacio debido a las condiciones de las raíces.