Tudo começou a muitos anos atrás, quando um cientista achou uma cápsula contendo um robô estranho. Este cientista conhecido como Cain, reativou a máquina adormecida e descobriu por consequência suas potencialidades e seu
nome : X.

Com base nas pesquisas feitas em X, Cain começou uma nova era criando os Reploids. Máquinas inteligentes e com um potencial de tarefas virtualmente infinito. E com tanto poder assim, algumas destas máquinas rebelaram-se contra a humanidade.

E assim surgiram os Mavericks. Reploids com apenas um intuito : Destruir seus criadores em nome de sua superioridade. Para enfrentar tal ameaça, Cain criou uma série de Reploids caçadores e sobre o comando destes colocou Sigma, sua melhor criação. Porém após uma luta contra um estranho Maverick vermelho que encontrava-se adormecido em um galpão abandonado, acontecera o pior. Sigma havia tornado-se um Maverick.

Após isso, a defesa da humanidade recai sobre o inexperiente X, e sobre Zero, um maverick reabilitado. Deste ponto em diante começam uma série de guerras entre Reploids e Mavericks que mencionamos em nossa história como "As Guerras Crônicas".