Hay muchas teorías para explicar la génesis de la identidad homosexual, la cual más bien ésta no ha sido investigada adecuadamente.
1. Factores Genéticos
Algunas investigaciones de la conducta humana indican que la orientación sexual tiene una base biológica. Los conocidos estudios de Kallmann y Eckert muestran una alta concordancia entre homosexuales gemelos monocigotos; sin embargo, el número de gemelos estudiados fue muy recducido. Hamer indica por su parte que hay un marcador del ADN en el cromosoma X que influencia la orientación homosexual.
2. Factores Hormonales
Tener déficit hormonales prenatales de estrógeno y de la hormona luteinizante está relacionado con el desarrollo de la homosexualidad, según los trabajos de Dorner, Money y Gooren. Los estudios de Rickets en especies no humanas como las ballenas indican también que éstas pueden cambiar de conducta sexual cuando son expuestros prenatalmente a andrógenos.
Vale la pena recalcar que estos estudios no tienen mucho respaldo científico debido a la diferencia generacional entre los niveles hormonales a nivel prenatal y a nivel adulto.
3. Diferencias Cerebrales
Algunos estudios de cerebros de hombres homosexuales muestran algunas diferencias comparativas con cerebros de hombres heterosexuales, como un aumento en la talla del núcleo supraquiasmático del hipotálamo, disminución en la talla del tercer núcleo anterior y aumento en la talla de la comisura anterior.
4. Factores Psicosociales
a. Desórdenes en las relaciones familiares: según algunas teorías psicosomáticas, las madres dominantes y padres pasivos pueden ser factores condicionantes de la conducta homosexual.
b. Experiencias de abuso sexual temprano: las experiencias de la infancia pueden determinar conductas homosexuales en el futuro, tal como plantea Arterburn.
c. Rebeldía: en algunas ocasiones el sentimiento de rechazo puede manifestarse como rebeldía, la cual durante la adolescencia puede expresar en conductas homosexuales.

Estos factores se han generalizado, pero se hace saber que no siempre es así, sino ¿Cuántas prostitutas hubiesen en este mundo?; muchas mujeres que han sido violadas a temprana edad, en la adolescencia o en la adultez y hoy día tienen familia y no son prostitutas; por lo tanto estos factores Psicosociales se catalogan absurdos. No todos los homosexuales han tenido sexo a temprana edad, más bien en la adolescencia y aun así no siempre llega ha una experiencia más a fondo. Tanto adolescentes homosexuales como heterosexuales han tenido sus experiencias; no se puede catalogar la homosexualidad como algo incógnito y depravado. En el mundo hay y siempre habrá de todo; desde homosexuales depravados, hasta heterosexuales depravados.