La situación geográfica del Estado, así como sus características geomorfológicas y climáticas, determinan la existencia de una gran variedad de tipos vegetativos, desde la vegetación de desiertos arenosos en los grades campos de dunas de la zona árida, hasta los bosques de pino y encino en la zona templada.
Benito Juárez, también posee una gran variedad de especies vegetativas, la vegetación en general la componen una asociación de árboles bajos como mezquites y brea, arbustos medios, cactáceas altas y bajas, así como agrupaciones de planta halófitas arbustivas que se encuentran en zonas próximas al litoral.
Selva Bajacaducifolia .- La cual puede alcanzar los 15 metros de altura, la mayoría de los vegetales son inermes y tiran sus hojas en la época seca que es muy prolongada, como especies más comunes tenemos: Bursera spp; Lisyloma spp; Ipomoea spp etc.
Matorral Sarcocaule .- Este tipo de vegetación se caracteriza por la abundancia de arbustos de tallo carnoso, gruesos, frecuentemente retorcido y algunos con corteza papirácea.
Mezquital .- El principal elemento que los constituye es el Prosopis spp (mezquite) Cercidium spp (palo verde), Acacia spp, etc.
Vegetación halófita .- Agrupaciones vegetales que se desarrollan sobre suelos con alto contenido de sales, las especies principales son el chamizo y saladillo.
