Данас се све теорије о пореклу нафте могу сврстати у две групе, и то:
1.теорија о неорганском-минералном пореклу нафте,
2.теорија о органском-биљно-животињском пореклу нафте

2.1.Теорија о неорганском-минералном пореклу нафте
Према теорији о неорганском пореклу нафта лежи дубоко у утроби земље. Угљеник и водоник су ужарене масе које продирући у земљину кору, под високим притиском и при високој температури, уз присуство разних супстанци као катализатора чине угљоводонике-основне састојке сваке нафте. Тако настала нафта из великих дубина постепено мигрира, пробија кроз пукотине стена и сакупља се у подземна лежишта.
Међутим, теорија о неорганском пореклу нафте има доста приговора, углавном везаних за примесе у природним нафтама као што су азотне, оптички активне супстанце које су везане искључиво за биљни и животињски свет.

2.2.Теорија о органском-биљном пореклу нафте

Теорија о органско-минералном пореклу нафте је најзаступљенија. По овој теорији, нафта је биљног, ређе  животињског порекла. Огромне количине органског материјала(алге, фораминифере...) таложиле су се у ранијим епохама по затвореним морима,језерима и већим барама. Тај се материјал под утицајем фермената, топлоте и притиска(око 15 милиона година раније) прво претворио у уље, а затим и у разне угљоводонике који су главни састојци нафте. Лежишта нафте се налазе на оним местима где је она прво  настала, услед разних тектонских поремећаја који су вршени кроз дуги период времена. У  пролог овој теорији може се узети и доказ присуства неких деривата хемоглобина у хлорофила у нафти. Присуство Мg2+и VO2+  као и сама њена оптичка активностнајбољи су докази да је нафта биогеног порекла.