¡Por fin, se encuentra la humanidad con los extraterrestres! Dos fuerzas están luchando entre sí en el inmenso espacio. Una es el Zentraedi que consiste en soldados solamente masculinos. La otra, Meltrandy, es una fuerza femenina. En 2001A.D., la Tierra se involucra en esta batalla. Mientras Macross, la fortaleza espacial, está luchando contra un ataque súbito, sale equivocadamente del sistema solar a su área del circunferencia sin ningún medio para volver. En el medio de miedo y desesperación, la cortina se levanta para una historia de batallas crueles. Para la supervivencia de humanidad, Macross lanza su último ataque con Lynn Minmay está cantante es la ultima esperanza.

Rápidamente después de su debut como cantante en Macross, ella se ha vuelto una estrella. El amor hacia Hikaru y la separación con él. A través de las varias experiencias en Macross, Lynn Minmay se ha desarrollado como una mujer y cantante.

Él aventaja a sus colegas en el talento y técnica como un piloto. Habiendo sido invitado por Roy Focker, él se une en el ejército. A pesar de que siente un gran cariño por Minmai, Hikaru se enamora de la valiente e introvertida lugarteniente Misa Hayase.