Celaya se encuentra en lo que algún día fuera una aldea otomí llamada Nat-Tah Hi (en el mezquite) El mandamiento virreynal se expidió el 12 de octubre de 1570. El primer día de año nuevo de 1571, se reunieron los encomendados bajo un árbol de mezquite, para cumplir con este mandato. En tiempo de Felipe IV, siendo Virrey de la Nueva España Don Francisco Fernández de la Cueva se confirmó la merced de la fundación y se otorgó el título de Muy Noble y Leal Ciudad con derecho a utilizar escudo de armas otorgándole el nombre castellano de: Villa de nuestra señora de la purísima concepción de Zalaya (tierra llana).

  El escudo de la Ciudad de Celaya fue otorgado en tiempo de Felipe IV, siendo Virrey de la Nueva España Don Francisco Fernández de la Cueva, se confirmó la merced de la fundación y se otorgó a Celaya el título de Muy Noble y Leal Ciudad con derecho a utilizar escudo de armas. El Escudo de la Muy Noble y Leal Ciudad de Zelaya de la Purísima Concepción tiene forma ovalada y se enmarca con una orla adornada con cinco carcaxes que simbolizan a las tribus indígenas sometidas. Consta de tres franjas con los colores azul, blanco y rojo. La primer franja es la de color azul símbolo de realeza y majestad ahí se encuentra la imagen de la Purísima Concepción, Patrona de la Ciudad. A la izquierda tiene una corona y el monograma F IV en memoria de Felipe IV, que concediera a Celaya el título de Ciudad. A la izquierda de la imagen se encuentra una cueva, para recordar que el título se obtuvo por mediación del Virrey de la Cueva. En el blanco hay una representación de los fundadores de Celaya reunidos bajo el mezquite. La franja roja tiene la divisa de -fortis dulcedo- encima de dos brazos desnudos que rinden los arcos como símbolo de pacificación de los chichimecas.

 Celaya tuvo mucha participación durante el periodo de Insurgencia de México. En las horas siguientes al grito de Dolores; Hidalgo y sus seguidores pasaron por Atotonilco Izcuipan (actualmente San Miguel de Allende) y Chamacuaro. El día 19 de Septiembre los insurgentes llegaban a las afueras de Celaya, haciendo su entrada triunfal el día 21 de Septiembre encabezados por Hidalgo. Se ha considerado a Celaya como la cuna del ejército mexicano ya que fue el 22 de Septiembre cuando se dio la primera organización formal de este tipo. Ese día fueron conferidos varios grados como el otorgado a Hidalgo de Capitán General; Ignacio Allende como Teniente General; más tarde estos cargos fueron modificados recibiendo Hidalgo el nombramiento de Generalísimo y un celayense Ignacio Camargo como Mariscal de Campo del Ejército Insurgente así como otros héroes celayenses

 Los días 13, 14 y 15 de abril de 1915 tuvieron lugar las renombradas batallas de Celaya en las que resultó triunfante el Gral. Álvaro Obregón sobre el Gral. Francisco Villa. Actualmente Celaya es una importante Ciudad dado a los servicios con que cuenta y a su grado de desarrollo.
 

En algún tiempo Celaya fue conocida como “el granero de México” ya que su producción en granos y cereales cubría las necesidades locales y lograba buenos excedentes para el comercio regional.