แมลงปอเป็นสัตว์นักล่า มันจะช่วยควบคุมปริมาณของแมลงชนิดอื่นที่เป็นโทษ ขณะเดียวกันมันก็ถูกล่าเป็นอาหารเช่นกัน ศัตรูของมันมีไม่มาก ตัวอ่อนอาจจะเป็นอาหารของ ปลา กบ หรือตัวอ่อนของแมลงปอที่โตกว่า ตัวเต็มวัยบินเก่งจับตัวยาก แต่ก็เป็นอาหารของเหยี่ยวฮอบบี้ (hobby) แมงมุม นอกจากนี้แมลงปอตัวใหญ่กว่าจะล่าตัวที่เล็กกว่าเป็นอาหาร มันอาจตกเป็นเหยื่อของพืชที่กินสัตว์เป็นอาหาร ยังมีพยาธิบางชนิดคอยเกาะกินแมลงปอ ทำให้อ่อนแอและเสียชีวิตในที่สุด ชาวอินโดนีเซียบางเผ่ากินซุปแมลงปอเป็นอาหาร แมลงปอยังเป็นตัวบ่งชี้ถึงระบบนิเวศน์ ที่ไหนมีแมลงปอมากแสดงว่าบริเวณนั้นมีแม่น้ำลำธารที่สะอาด อากาศที่เลวร้าย เช่น หนาวเย็นจัด พายุฝน น้ำท่วม หรือแห้งแล้งมากจนแม่น้ำลำธารแห้งเหือด เป็นระยะเวลานาน ทำให้แหล่งอาหารของมันลดลง แต่ ปัญหาใหญ่ที่สำคัญคือการคุกคามจากมนุษย์ ทำให้ถิ่นที่อยู่ของมันลดลงเรื่อยๆ แมลงปอแต่ละชนิดต้องการถิ่นที่อยู่แตกต่างกัน บางชนิดต้องการถิ่นที่อยู่ที่มีลักษณะเฉพาะซึ่งมีจำนวนน้อยลง ชนิดนี้มีโอกาสสูญพันธุ์ได้ง่าย บางชนิดอยู่ได้ในน้ำทุกชนิดแม้แต่ในน้ำกร่อย (brackish) ก็อยู่ได้ พวกนี้ไม่ค่อยมีปัญหา บางชนิดต้องการลำธารที่มีน้ำไหลตลอดเวลา บางชนิดอยู่ในน้ำนิ่ง บางชนิดอยู่ใน ห้วย หนอง หรือบึง บางชนิดอยู่ในที่ชื้นแฉะ ถิ่นที่อยู่เหล่านี้กำลังลดลงอย่างรวดเร็ว แม่น้ำลำคลองที่เหลืออยู่ก็สกปรกเกินกว่าที่จะดำรงชีวิตอยู่ได้ จึงเป็นความจำเป็นอย่างยิ่งที่ต้องช่วยกันหาแหล่งน้ำเพิ่มขึ้น เช่น ขุดสระเพิ่มในสวนหลังบ้านหรือโรงเรียน รักษาแหล่งน้ำต่างๆให้สะอาด จัดตั้งกลุ่มเพื่อช่วยเหลือแมลงปอ หรือแม้แต่การถ่ายภาพแมลงปอสวยๆ เก็บไว้ให้ชนรุ่นหลังได้ชมก็ยังดี