Les microorganismes ont été divisés, en génétral, en trois grands règnes - les monères, les protistes et les virus - selon la classification des etres vivants en cinq ou six regnes - planta, animalia, fungi, protista et monera (ou monera et viruses si l'on classe les virus avec les organismes vivants ("free living organisms").
Les Bacteries
Les bacteries sont des procaryotes, i.e. des microorganismes dépourvus d'une membrane nucléaire. Le règne des bacteries comprend deux grandes divisions:
- les archebacteries qui sont les plus anciennes bacteries qui ont existe sur terre, les premiers etres vivants desquels remonte l'evolution des etres vivants sur terre: "The Archaea Are Prokaryotes in Morphology, But ...The Archaea are not eukaryotes, which makes them prokaryotes. However, the fact that they are related to Eucarya, not to the other prokaryotic organisms (the Bacteria), means that prokaryotes are not a natural group.23 This is difficult to fully appreciate, since we tend to accord a special status to eukaryotic cells. It is perhaps most easily understood by considering the ability to learn about one group from another: If we wonder about a biosynthetic reaction in a eukaryote, it makes more sense to use a member of the Archaea as a model than to use a member of the Bacteria. Even though much more money is being spent on analysis of eukaryotic genomes than prokaryotic genomes, due to their smaller size, some prokaryotic genomes will be completed first. Of these, it appears that we will learn more about human genes from the archaeal genomes than from the bacterial genomes, " we will learn more from the archeabacterial genome than from the bacterial genome (Ref.: Olsen, G.; Archaea; University of Illinois; c. 2003) (reserve a l'auteur: p.1, p.2 et p.3)
- les eubacteries qui sont les bacteries modernes ou plus recentes et qui sont reconnues comme les vraies bacteries alors que les archebacteries ne sopnt plus classees avec les bacteries
LES EUBACTERIES: Elles sont divisees en deux grands groupes: les bactéries hétérotrophes (que nous connaissons mieux), appelées les "bacteriacae" - elles causent un grand nombre de maladies infectieuses - et les bacteries photosynthetiques ou cyanobactéries qui sont des organismes autotrophes
Les BACTERIES HETEROTROPHES sont ces bactéries les plus connues du monde médical. Quelques unes sont des autotrophes, i.e., fabriquent leurs propres aliments en utilisant l’énergie solaire ou l’énergie chimique, d’autres sont hétérotrophes. Ce groupe inclut trois principaux groupes:
- les bactéries schizomycètes: celles-ci seront elles-même divisées, ici, en trois grands groupes:
- les bactéries en forme simple de sphère, de bâtonnet ou de spirille; ce groupe comprend:
des cocci - streptocoque, staphylocoque et gonocoque - qui causent des infections purulentes de la peau et des muqueuses (nez, pharynx, vagin, etc.),
- des bacilles ou bâtonnets simples, tels, par exemple: celui de la tuberculose - M. tuberculosis, le clostridium dont une espèce cause le tétanos et l’autre le botulisme, celui-ci étant un empoisonnment alimentaire causé par des aliments conservés (vinaigre, etc.) mais contaminés; l’E. coli qui est un saprophyte qui vit dans nos intestins
- des spirochètes qui sont des bactéries spiralées, tels, par exemple: le tréponème pallidum, le bacille de la syphilis, cette maladie vénerienne grave, et le leptospire qui cause une forme de la jaunisse;
- des bactéries en forme de filaments multibranchés que sont les actinomycetes, comme le streptomycète;
- Le troisieme groupe est un groupe hétérogène, formé des plus petites bactéries sur terre, dont font partie les ricketssies, les chlamydies et les mycoplasmes;
Les BACTÉRIES PHOTOSYNTHÉTIQUES OU AUTOTROPHES que sont les cyanobactéries (formerly known as blue-green algae) sont les plus anciennes eubacteries qui ont existe sur terre; celles-ci ont existé sur terre, il y a de cela 2,7 billions d’années et ont fait le replein en oxygène de l’écosphère terrestre apres que les premiers hétérotrophes l’eurent épuisé.
CLASSIFICATION DES BACTERIES selon la methode moderne de classification des etres vivants:

Si je devais tenir compte de ce cladogramme, je classerais, suivant la methode de classification moderne a trois domaines ou a trois empires-- archeae (represente, en grande partie par les archebacteries) - monerae (moneres, bacteries ou procaryotes) - eucaryotes (representes par les animaux, les vegetaux et les protistes), le staphylocoque dore comme suit:
-
domaine des moneres ou des procaryotes --> regne des eubacteries ou des bacteries modernes --> embranchement des Firmicutes --> classe des Bacilli --> ordre des Bacillales --> famille des Staphylococcaceae--> genre Staphylococcus --> espece: Staphylococcus aureus.
Une autre methode de classification des bacteries se base sur la methode d'identification au laboratoire medical.
--------------------------------------
References:
- Uzeby, J.P.; List of prokaryotic names with standing in nomenclature
- Espace Etudiant; Cours de bacteriologie generale
- Olsen, G.; Archaea; University of Illinois; 2003