Considerado por muitos como um dos games mais "chatos" da série Resident Evil, Resident Evil: Gaiden (Biohazard: Gaiden) lançado em 2001 para Game Boy Color, tem uma história considerada não-oficial, sendo que alguns temas retratados no game não são explorados pelos games seguintes.
Após o incidente em Raccoon City, alguns sobreviventes, entre eles Leon Scott Kennedy, unem-se em uma Organização Anti-Umbrella. Leon, o ex-policial novato de Resident Evil 2, agora é enviado para investigar um navio de propriedade da Umbrella, o Starlight, mas desaparece à bordo. Assim, Barry Burton, (de Resident Evil) é enviado atrás de Leon, não só para encontrá-lo, mas também para descobrir a verdade por trás do Starlight. O protagonista agora acaba por enfrentar um verdadeiro inferno, ao descobrir que todos, ou quase todos, no navio haviam sido infectados e transformados em zumbis. Barry acaba se encontrando com Leon, e com Lucia, uma garota que ainda conseguira manter-se viva.
O final do game, um tanto estranho, mostraria Leon sendo possivelmente infectado com um parasita, (Há um estranho sangue verde em seu pescoço), porém, isso não foi explorando em game seguintes, sendo assim, Gaiden não é considerado como oficial na cronologia da série.