最近一次大規模感染是於1995年發生在薩伊的奇魁德
（Kikwit），318位患者總共有244人死亡．
當時美國疾病防治中心（CDC,Center for Disease Control）
對當地五萬隻野五萬隻野生動物一隻一隻進行調查，
大規模尋找伊波拉病毒的寄主．
由於未找到檢測出伊波拉病毒基因．抗原的動物，
伊波拉病毒的自然寄主至今仍不明．
避免直接接觸患者血液即可防止感染，但是非洲大陸開發中國家，
因為處在口罩．手套．實驗衣不足且注射針重複使用的狀態下，
至今仍無法有效防止感染擴大． 　　

雖然確定人類由黑猩猩感 染伊波拉病毒，但是黑猩猩感病毒也會死亡，
因此很難認為黑猩猩是伊波拉病毒的自然寄主．
調查人員逐一採集黑猩猩可能接觸到的其他猿猴．蝙蝠．
老鼠．鳥類．爬蟲類．昆蟲等動物，採取牠們的血液．
解剖牠們身體．結果在黑猩猩最愛吃的獼猴科（Cercopithecidae）疣猴（Colobus）
屍體中，找到可能導致疣猴出血而死的兇手．
卻發現疣猴是因感染伊波拉病毒以外的理由出血而死，
調查 又回到一張白紙．

在目前極難找到自然寄主的情況下，
加上伊波拉出血熱的發生十分罕見．
發生地區相隔遙遠，於是懷疑自然寄主可能是蝙蝠．
以前爆發伊波拉出血熱的地區，無論是在建築物或山中，
的確可見到許多蝙蝠．
而與伊波拉病毒同屬費拉病毒科的馬堡病毒（Marburg virus），
它所引起的出血熱，過去3次中有2次的發生和蝙蝠洞有關，
因此伊波拉病毒的自然寄生有可能是蝙蝠．