El nombre primitivo de Ixmiquilpan fue zectccani de origen otomí que significa verdolaga.

Posteriormente, en idioma nahoa se llama Izmiquilpan, y por corrupción se llegó al actual. Sin embargo, otra versión expresa Itzmiquilpan , que se forma de Itztli que significa navaja; y milli, tierra cultivada, más la palabra quilitl, que significa hierba comestible, y por último pan cuyo significado es sobre. De manera que quiere decir:Pueblo situado sobre los cultivos de hierba cuyas hojas tienen la forma de navaja.

Con motivo de la Revolución Mexicana, las autoridades de Ixmiquilpan, necesitadas de dinero, exigieron el pago de contribuciones ocasionando que se dieran rebeliones de indígenas y levantamientos en Orizaba y Remedios que fueron acaudillados por Sotero Lozano, nativo del Cardonal.

Entre los años de 1906 a 1910 se construyó el Palacio Municipal y el Teatro Hidalgo que fue inaugurado antes de las Fiestas del Centenario de la Independencia.

El primero de Diciembre de 1912 se inauguró el puente del barrio del Maye, construido por iniciativa del Sr. Don Fernando Alvarez vecino del lugar para comunicar a la comunidad con el centro de la población.

En el año de 1918, el primer Jefe de Venustiano Carranza visitó Ixmiquilpan, al inaugurar el tramo de vía férrea entre Pachuca y ésta población; la cual llegaba hasta la estación del Nith. El ferrocarril empezó a funcionar con normalidad hasta el año de 1919, hacía el recorrido en la mañana y llegaba a la estación del Nith al mediodía distancia que es sólo de 6 km. de Ixmiquilpan.

En la época de Gobierno del Sr. General Lázaro Cárdenas del Río, se construyó la Presa del Tecolote, aprovechando las aguas del río Tula, los canales de riego El Morelos y €œEl Moro que vinieron a substituir el antiguo canal de €œEl Bondhé aprovechando también las aguas de la Presa de Capula y las aguas negras de la Ciudad de México que por aquel entonces empezaba a irrigar las tierras labrantías de ésta región del Valle del Mezquital. A fines de los años treinta, se amplió el sistema de riego, construyéndose la presa de El Maye, posteriormente, se construyó la presa Felipe Angeles en la comunidad de El Alberto.

En marzo de 1939, en Ixmiquilpan se lleva a cabo el primer aniversario de la expropiación petrolera en aquella ocasión el Presidente de la República, el General Lázaro Cárdenas estuvo presente en la población.

En Mayo de 1942 estuvo el Presidente de la República, General Manuel Avila Camacho para inaugurar el mercado municipal.

El 3 de abril de 1952 se inaugura y entra en servicio la Escuela Secundaria Justo Sierra que en sus inicios funciono como Escuela Secundaria por Cooperación instalándose en la casa del Profr. Raúl Guerrero Guerrero, en la Avenida Hidalgo No. 34; posteriormente se traslada al antiguo edificio que actualmente ocupa.

En 1969 se da una ampliación urbana en donde se pavimentan las principales calles, se instala nuevo alumbrado público, remodelan la plaza principal e instalan la fuente monumental y estatua de La Diana Cazadora. 
 

Toda esta transformación se hizo bajó iniciativa del Lic. Alfonso Corona del Rosal, por aquel entonces Regente de la ciudad de México y nativo de ésta población.