Junto con declararse la Guerra, la Escuadra Chilena puso bloqueo a Iquique, principal puerto del sur del Perú, el Almirante chileno Juan Williams pensaba que este hecho sumado al hostigamiento de la costa sur del Perú obligaría a la escuadra peruana a salir a su encuentro y decidir rápidamente la campaña, este plan que Williams eligió supuso el rechazo del plan del Capitán de Fragata Arturo Prat, quien estaba convencido de que era posible en ese momento asaltar el Callao, donde los fuertes aún no constituían un peligro y de esa forma también se podía acabar con la escuadra peruana surta en dicho puerto, misma que aún estaba alistándose para la campaña, sea como fuere el plan de Prat fue rechazado, y la operación de hostigamiento sobre el sur del Perú se inició.

Junto con iniciarse el bloqueo de Iquique, el alto mando peruano determinó enviar al sur a sus únicas unidades operativas, los transportes Chalaco y Talismán, cargados de tropas, pertrechos y elementos para fortificar Arica y transformarla en una futura base de operaciones, al mismo tiempo fueron despachados la Corbeta "Unión" y la Cañonera "Pilcomayo", su misión ponerse al acecho en las cercanías de la desembocadura del río Loa e interferir el trafico mercante chileno, quiso la suerte que el 12 de Abril de 1879, estas unidades se encontraran con la cañonera chilena "Magallanes", unidad mandada por J.J. Latorre y que se dirigía a Iquique a reforzar el bloqueo, fue ese día cuando las escuadras de Chile y de Perú intercambiaron los primeros disparos en el mar, en el llamado combate naval de Chipana lo cierto es que más bien se

Sea como sea, la noticia de la audacia peruana molesto a Williams, y en vista de que no pudo localizar a las naves peruanas inició el hostigamiento de las caletas y puertos menores peruanos, de esta manera las unidades chilenas dejando a las unidades más débiles manteniendo el bloqueo de Iquique operaron contra Pabellón de Pica, Huanillos, Pisagua y Mollendo, estas operaciones determinaron la primera baja mortal de la marina chilena en combate, ya que a la destrucción de los elementos de embarque y captura de los botes los peruanos ofrecieron resistencia armada en Pisagua y Mollendo, este triste honor le tocó al Capitán de Altos FRANCISCO MANSER, de igual manera salieron heridos 11 hombres, como represalia, la escuadra chilena bombardeó ambos puertos.

Luego de estas operaciones realizadas a principios de Abril las unidades chilenas volvieron a concentrarse en Iquique, donde se mantuvo inactivo por el resto del periodo, pero por esas fechas por fin el "Huascar" y la "Independencia" quedaban operativos.