Madoka Kaname: (鹿目 まどか Kaname Madoka) es la protagonista del anime y manga Puella Magi Madoka Magica. Es una niña gentil y amable que vive una vida normal, tiene una vida feliz, rodeada por una buena familia y buenas amigas. Un día, tiene un sueño en el que una chica misteriosa pelea contra un monstruo. Al día siguiente, la chica del sueño, Homura Akemi, llega a su colegio como estudiante transferida.

Su vida cambia cuando se encuentra con Kyubey, el cual le ofrece un deseo a cambio de que ella se convierta en una Puella Magi. Se tiene entendido que ella posee un gran potencial mágico en su interior y Kyubey está particularmente interesado en hacer un contrato con ella.

Homura Akemi: (暁美 ほむら Akemi Homura) es una Puella Magi que aparece por primera vez en el sueño de Madoka, y que luego se transfiere a su escuela. Es una chica bella pero misteriosa que tiene notas excepcionales en la escuela, ya sea en lo académico o atlético, por lo que es muy popular en la escuela a pesar de su personalidad seria.

Homura tiene un amplio conocimiento sobre diferentes Puella Magi y es muy consciente de los lados oscuros de cada una. Además, ella trata de mantener alejadas a Madoka y Sayaka de los contratos con Kyubey, en particular a Madoka, a quien parece conocer mucho. A menudo se esfuerza para proteger a Madoka y a las demás del peligro que las amenaza.

Mami Tomoe: (巴 マミ Tomoe Mami) es una Puella Magi que ya había hecho un contrato con Kyubey y que aparece justo para salvar a Madoka y Sayaka de la bruja Gertrud en el Episodio 1.

Vivía sola en un apartamento después de la muerte de sus padres. A diferencia de otras Puella Magi, que en su mayoría se centran en obtener Semillas del Sufrimiento, Mami se centra particularmente en la protección de los que la rodean. A pesar de que a menudo tiene un carácter alegre, también es solitaria y temerosa debido a las presiones de ser una Puella Magi. Muere tras ser devorada por la bruja Charlotte en el Episodio 3.

Sayaka Miki: (美樹 さやか Miki Sayaka) es la mejor amiga de Madoka.

Después de ayudar a rescatar a Kyubey, termina recibiendo una oferta para convertirse en una Puella Magi. Ella se preocupa profundamente por sus amigos, y quiere ayudar a su amigo, quien esta paralítico del brazo, Kyosuke Kamijou, de quien está enamorada.

Sayaka se convierte en una Puella Magi después de usar su deseo en curar la mano de Kyosuke. Sin embargo, más tarde cae en desesperación y se convierte en una bruja. Se a dicho que sayaka no llegaría a ser feliz en ininguna línea de tiempo aunque se quedase con kyosuke.

Kyoko Sakura: (佐倉 杏子 Sakura Kyoko) es una Puella Magi de la ciudad vecina, Kasamino.

Despues de la muerte de Mami, aparece para intentar tomar su lugar, hasta que llega Sayaka Miki. Kyoko trata de eliminarla, pero finalmente termina compadeciéndose de ella y advirtiéndole de que cometerá los mismos errores que ella. Es menor que Mami, pero mayor que Sayaka y Madoka.

Es la única Puella Magi que no aparece en el primer episodio.