Alguns antibióticos causam reações alérgicas extremas nos hamsters ou são tóxicas e devem ser utilizados com alguma cautela. Estes antibióticos estão listados baixo:
-Amoxicilina
-Ampicilina
-Clindamicina
-Dihidrostreptomicina
-Eritromicina
-Lincomicina
-Penicilina
-Estreptomicina
-Tetraciclina
Antibióticos que podem ser utilizados seguramente por hamsters: Baytrill e Neomicina.
Qualquer medicamento projetado para uso humano, ou para outra espécie (como cão, gato), não devem ser administrados à hamsters a não ser quando receitados por um Médico Veterinário.