El agente Fox William Mulder es un psicologo que ha estudiado en Oxford, uno de los mejores agentes de la division de crimenes violentos del FBI, aunque no este de acuerdo con sus superiores ni companieros sobre el interes de los "Expedientes X" del departamento.

Su fascinacion con los fenomenos paranormales surge de un incidente ocurrido en su niniez, su hermana Samantha desaparecio de su hogar en Vine Street en la localidad de Chilmark, Massachusets, cuando el tenia 12 anios y ella 8. Mulder insiste en que ella fue raptada por extraterrestres: durante regresiones hipnoticas recordo oir los gritos de auxilio de su hermana, y una luz brillande que lo paralizaba y le decia que no se preocupase, que su hermana estaria bien [Conduit]. Este recuerdo difiere un poco del suenio que Mulder tuvo una noche [Little Green Men]. Mulder establecio contacto con un hibrido extraterrestre que aseguraba ser Samantha y un cazador de recompensas le dijo que su hermana estaba viva. El ha prometido continuar su busqueda [Colony/End Game].

El ascenso meteorico de Mulder en el FBI le permitio hacerse amigos bien situados en el Congreso, uno de ellos el impulsor del SETI e influyente senador Richard Matheson [Little Green Men]. Estos contactos lo han salvado del castigo de otros mas poderosos, aunque le asignaron un companiero para desacreditarle. De todos modos, Mulder encontro un aliado,   un individuo conocido como Garganta Profunda. [Deep Throat, Fallen Angel, Eve, Young at Heart, E.B.E., Erlenmeyer Flask].

Garganta Profunda fue asesinado por un asesino igualmente misterioso durante un intento de rescatar a Mulder. Mulder confirmo su entierro en Arlington "a traves de unos prismaticos a mil yardas de distancia".[Little Green Men]. Pero pronto consiguio un segundo confidente, alguien conocido como X. [Sleepless]. Este hombre misterioso seria de menos ayuda para Mulder que el anterior.

En el fin de la primera temporada, los "Expedientes X" eran cerrados y Mulder reasignado a vigilancia telefonica. [Little Green Men, The Host]. Se le dio un nuevo companiero, el agente especial Alex Krycek [Sleepless, Duane Barry, Ascension], un agente mas joven que pretendia ser un creyente, no solo en las ideas de Mulder sino en el mismo Mulder. Pero los dias de Mulder de esta forma estaban contados. Skinner indirectamente agradecia al departamento de Expedientes X de haber servido al FBI resolviendo con exito los caso mas extranios [The Host] y sacando a la luz informacion que algunos preferirian mantener enterrada. [Ascension] Tras la desaparcion de Dana Scully, Skinner reabre oficialmente los Expedientes X [Ascension].

Al final de la segunda temporada, Mulder obtiene un documento clasificado por el Departamento de Defensa, un documento codificado en navajo que parece tener informacion sobre una posible operacion encubierta del gobierno desde hace 50 anios. Sus rivales tratan de desacreditarlo adulterando su agua con una sustancia que lo hace violento. Su padre, que tenia que ver en la operacion, es asesinado, con Mulder como el primer sospechoso. Escondiendose con Scully, Mulder termina en Nuevo Mexico investigando evidencias que prueban la validez del documento secreto. Fue perseguido por El Fumador, que intenta matarlo. [Anasazi]. El disco se encuentra ahora en posesion del Hombre de los Cigarrillos. [Apocrypha].

Mulder se recupero gracias a la intervencion de los navajos y volvio a la costa este para recoger los efectos personales de su padre muerto, encontrando una foto de los 70 de un grupo interesante de hombres. [The Blessing Way] De regreso a D.C., se encuentra con Scully y recibe ayuda de los Pistoleros Solitarios y uno de los hombres fotografiados para descubrir la localizaci�n secreta de los expedientes concernientes a la operacion encubierta: registros medicos y muestras de ninios vacunados en los 50 y los 60, incluida Scully. En la huida de sus oponentes son ayudados por Skinner, quien negocia un trueque con El Fumador para la vuelta de los agentes y su salvaguarda.

Al final de la cuarta temporada, desesperado por descubrir lo que ocurrio en su infancia, se somete a una terapia para descubrir lo que ha hecho que varias personas se suiciden [Demons]. Poco despues [Gethsemane], embarca hacia Canada, en busca del cadaver congelado de un extraterrestre. Tras realizarle unas pruebas medicas ya en Estados Unidos, el cadaver desaparece. Scully le presenta a un hombre de Defensa que le confiesa que toda su vida es una tremenda mentira desarrollada por el Gobierno: desde la hipnosis hasta la historia de su hermana, incluyendo la enfermedad de Scully, provocada para enganiarlo. Sumido en una gran crisis agravada por los efectos de la terapia [Demons], Mulder parece suicidarse al final de la cuarta temporada [Gethsemane]. Sin embargo, la realidad es que Mulder descubre, gracias al hombre de Defensa, que esta siendo espiado por el ejercito desde el piso superior. Cuando sube al piso superior tiene un tiroteo en el que mata al espia. Entonces aprovecha el cuerpo de este para hacer creer que es el (le dispara a bocajarro en la cara para que no pueda ser identificado). Mulder aprovecha su 'muerte' para poder investigar con mas facilidad [Redux], desvelandole solo a Scully su enganio. A traves del hombre de Defensa tiene conocimiento de que el gobierno americano ha estado relanzando el tema extraterrestre con el fin de ocultar experimentos biologicos y otras cosas, de que todo lo que el cree es una invencion del gobierno creada por gente como el. Mulder consigue introducirse en el Pentagono (bajo el consentimiento no conocido por el Fumador) y tiene acceso a informacion que terminara siendo vital para la vida de Scully gracias a la ayuda del Fumador. Las sospechas sobre la paternidad del Fumador aumentan al presentarle este a su hermana, la cual ha estado buscando durante tanto tiempo y que cree que el Fumador es su padre. Sin embargo, Samantha no se siente preparada para afrontar esa realidad y promete a Mulder que se pondra en contacto con el cuando lo este. Mulder rechaza la proposicion del Fumador de trabajar para el aunque reconoce que le ha dado "las dos cosas que mas queria en esta vida"(su hermana y la cura de Scully).

A Mulder se le conoce en el FBI como "Siniestro" [Piloto, Young at Heart] debido a su increible capacidad de procesar informacion y llegar a conclusiones logicas y a su interes en los fenomenos paranormales. Se le considera un "bala perdida", una persona que pierde el tiempo y el dinero, y su opinion tiene poco valor en el area del FBI. Debido a un incidente en una de sus primeras misiones en el FBI (un joven agente fue asesinado) [Young at Heart], el sigue sus investigaciones con el cuaderno, en vez de usar sus propios instintos y metodos. Toma notas para sus informes de campo en un diario escrito a mano [Born Again]. Su alias favorito es George Hale [Little Green Men, Sleepless].

Creemos que Mulder no tiene una vida propia, como hemos visto en sus actividades fuera del deber. De todos modos, mucho de esto podria tener que ver con la relacion que tuvo en Oxford 10 anios antes con una mujer que trabaja ahora en Scotland Yard (Phoebe Green[Fire]). El parecia estar enamorado de ella, pero no al reves. Con la disolucion de los Expedientes X, Mulder podria haber intentado revivir su vida social: un mensaje en el contestador le criticaba por haberse perdido una cita para cenar [Little Green Men]. Un personaje que se hace pasar por el para seducir a Scully lo llama 'fracasado' [Small Potatoes], por no haber entablado nunca relacion fuera del trabajo con ella. Scully lo consuela diciendole que ella no lo considera asi, a lo que el responde disgustado que ya, pero que el tampoco es ese personaje (para seducirla).

Mulder nacio el 13 de Octubre de 1961 [Paper Clip]. Sus padres parecen haberse separado. Su padre, Bill, trabajo en un proyecto secreto para el Departamento de Estado, y fue asesinado por Krycek antes de decirle a Mulder secretos sobre su pasado. [Anasazi]. La madre de Mulder le confirmo que Samantha habia sido secuestrada para asegurarse el silencio de su padre sobre sus actividades encubiertas. [Paper Clip]

Tiene panico al fuego [Fire], que pudo ser adquirido durante el rescate de los hijos Sir Malcom Marsden. Es tambien un fan de la NASA. [Space]. Le encanta comer panizo (habito que comparte con su padre [Aubrey]), y hacer comentarios graciosos que han empezado a llamarse "mulderismos".

Mulder es daltonico [Wetwired], disfruta poniendose corbatas un poco salvajes para trabajar, y es un fan de los New York Knicks [Beyond the Sea, Little Green Men] asi como de los Washington Redskins [Irresistible]. Tiene una debilidad por el rock clasico [peque�as referencias, Beyond the Sea, Genderbender] y las peliculas clasicas de ciencia-ficcion [Tooms, Erlenmeyer Flask], y un te helado es su bebida no alcoholica preferida [Tooms]. Tambien se mantiene en forma corriendo [Piloto, Deep Throat, Humbug] y nadando [Duane Barry].