Existen varias razones por lo que es adecuada la utilización de software libre en la investigación biológica. A continuación describiré brevemente algunas de ellas:
TRANSPARENCIA: Usar cualquier sistema operativo o programa libre supone utilizar una herramienta cuyo código fuente siempre está disponible.La transparencia del software libre entronca perfectamente con la tradición científica de hacer públicos todos los procedimientos de investigación.
POTENCIA, ESTABILIDAD Y FLEXIBILIDAD: Los sistemas operativos libres y sus programas asociados son en general más estables y potentes. Otra gran característica de los sistemas libres es su flexibilidad. En ellos se puede ajustar absolutamente todo el sistema en función de los conocimientos y necesidades del usuario.
ECONOMIA: El software libre, por lo general, es gratuito, aunque no hay que confundir nunca estos dos parámetros.
La mayoría de las herramientas más utilizadas en bioinformática se pueden descargar íntegramente de la red. Por esta misma razón, hay muchos países en vías de desarrollo que están optando por la utilización de software libre en sus organismos oficiales, universidades, etc.
INDEPENDENCIA DE PLATAFORMA: Afortunadamente, en bioinformática se han desarrollado formatos de archivo manipulables en cualquier sistema operativo, esto debido a que la gran mayoría del software utilizado en el área se encuentra disponible tanto para plataformas libres como propietarias.
El ser usuarios de una plataforma abierta y libre nos permite tener un control absoluto de las herramientas que utilizamos.
RESPETO A LOS ESTÁNDARES: Si utilizamos software libre tenemos la garantía de que los datos que produzcamos respetarán los estándares abiertos y públicos. Los científicos o técnicos deberían ser especialmente sensibles hacia esta problemática, ya que es precisamente la labor científico-técnica la que más escrutinio requiere, sobretodo de colegas pero también del público en general.
