腸病毒感染並沒有特別療法，民眾必須注意個人衛生及避免接觸感染者。少數嚴重併發症，在發生之初，若能及早治療，可增加治癒機會。
腸病毒感染症狀可分為五期，絕大多數病童在第一期即可復原。
少數，尤其小於兩歲的小孩，若有第二期症狀必須立刻送醫治療。
第一期：
發燒、食慾不振、喉嘴或口腔發炎、流涎、皮膚症狀。
第二期
發燒、哭鬧噪動不安、睡不著覺、無端驚慌、懼光、嘔吐、腹脹、嚴重頭痛、輕微肢體活動異常、說話不清楚。
第三期
高燒、嘔吐、嗜睡、肢體無力、心律加速、臉無表情、視幻覺、眼球抵制失調。
第四期
低體溫、肌躍動性抽搐、突發性呼吸衰竭、神經性條休克現象、意識不清、肺及消化道出血。
第五期
昏迷、成人型呼吸窘迫症狀、心肺功能衰竭、死亡。