「子宮內膜異位症」顧名思義是子宮內膜生長在子宮腔以外的地方，因而造成的疾病稱之。若長在卵巢內，則形成所謂的「巧克力囊腫」，而長在子宮肌層的的則稱做「子宮肌腺症」。子宮內膜跑出子宮外成長的成因，至今仍不是很清楚；但依各類理論大致可分成下列幾種致因：

1.月經逆流

月經來潮子宮收縮時，除了把剝落的子宮內膜，經由子宮頸排出體外之外，也把子宮內膜經由輸卵管推入腹腔。

2.由血液淋巴系統傳送

不少的子宮內膜組織，也把子宮血管和淋巴管在子宮內的開口，轉送到身體的其他部位如肺部、肚臍、淋巴結等處。

3.自體免疫缺損

子宮內膜在經期時，到處亂跑的情形是非常普通，只是這些組織碎片，都很快被身體的白血球與淋巴球吞噬殆盡；只有少數的女性，她們的身體無法吸收過多的內膜組織，於是這些內膜組織，就附在人體的其它組織，如：卵巢、輸卵管、膀胱、大腸、子宮直腸凹陷。