藥物治療不能視為子宮內膜異位症的完全根治，而只是一種輔助治療。許多女性同胞懼怕腹腔鏡而希冀能有不同於手術的另類治療。藥物療法可視為一種短期壓抑性的權宜措施，使用藥物將異位性的內膜萎縮或減少，使其造成不孕或引發經痛的影響降低，從而讓體內免疫系統吸收病灶；或趁病狀減輕的空檔，趕緊懷孕；或接著手術，以去除殘餘組織，可降低再發機率，都是使用藥物的主要目的。

　　國內治療子宮內膜異位症的藥物，主要有兩種，一是男性荷爾蒙衍生物，亦即使用已有十年以上的療得高，一是腦下垂體荷爾蒙類似劑，目前有短效的噴鼻劑型及長效的針劑型。其主要作用，均是降低體內女性荷爾蒙的濃度，使賴以維生的子宮內膜異位病灶停止生長，甚至萎縮，以達到減輕病狀的目的。但兩種藥物的作用方式，卻是南轅北轍，各不相關。所造成的副作用，亦各自不同。這也是女性同胞們最關心的事項。

　　先說療得高(DANAZOL)，由於它是一種男性荷爾蒙的衍生物，主要的作用乃是抑制體內女性荷爾蒙的生成。因此使用的女性會產生少許男性化的反應，如體重增加（約3∼5公斤），長青春痘，皮膚油膩，毛髮為粗等。有些病人還會發生抽筋，肌肉酸痛等現象。這些現象的發生率在30％∼80％，隨藥物使用的劑量而增加，是許多病人不能持續使用的主要原因。還好這些副作用的是暫時性的，當藥物停止之後，即會慢慢恢復，並無長期後遺症的報導。除此之外，使用療得高尚有一些注意事項，亦即服用當中不可懷孕，否則極易導致胎兒畸型；再者，肝機能異常，高血脂症者亦不適宜使用，這些是在選擇此藥之前必須注意的。

　　至於腦下垂體性腺荷爾蒙類似劑（很坳口的名字，我寧可叫它英文簡稱的GnRhA），它的作用方式主要是抑制腦下垂體性腺荷爾蒙的分泌，短效型必須一天使用好幾次，但好處是停藥後馬上恢復卵巢功能，藥性比較容易控制。長效型則作用超過一個月，只要每個月打一針，其他日子都可忘了它的存在。壞處也是以上的相反：作用超長，不易控制，有時停藥一兩個月，尚不能恢復月經。這些藥物的作用是完全停止性腺荷爾蒙的分泌；幾乎等於停經，相對地便有假性停經症候群的出現。使用者偶而會有臉頰發熱、不眠、腰酸背痛、心情煩燥的現象，但不常發生；另有一獨特副作用，必須說明，即使用GNRHA如超六個月，便可能出現骨質疏鬆的可能性（大約減少百分之三），雖然停藥之後即可恢復，但醫界仍建議不要使用超過六個月，以防止其發生。

　　使用期限在六個月內，並不需要擔心，亦不需特意地使用額外的鈣片來補充骨質。這兩種藥物，雖然各有其副作用，幸運的是停藥之後，絕大多數可完全恢復，因此都可放心地使用，不用擔憂以後的後遺症，且兩者藥效均等，要如何使用，應由您的主治醫師依照您的體質來決定。