O nome Ilha do Frade Futebol Clube surgiu do condomínio Ilha do Frade onde reside grande parte dos jogadores da equipe.
Em meados de 1990 os garotos do Ilha iniciaram suas peladas, mas no início o time era fraco e era formado apenas por moradores e ex-moradores. A equipe era comandada por Junão, não tinha jogadores fixos e nem uniformes.
Nos dois últimos anos o time passou a ser comandado pelo Biri que aderiu a idéia de que o Ilha deveria abrir as portas para seus amigos mais próximos e tornar-se um "clube-empresa".
Com isso a equipe foi sofrendo várias transformações até chegar a formação ideal e atual. Certo de que o elenco seria vitorioso e duradouro, o time começou a organizar-se, conseguindo patrocínios e associando-se com o clube Cultura, onde o Ilha manda seus jogos.
A estréia do uniforme foi em dezembro de 2001 em uma noite de quinta-feira, dia 19. O jogo foi contra o Manés e Migués e o resultado não podia ser diferente: vitória do Ilha por 5x2, com gols de Sandrão(2), Pirão, Boi e China.
A partir de então, o Ilha passou a trilhar um caminho de vitórias, raça e união.
