2035 (cont.) El Ark Angel ha estado evitando el destino del resto de las naves de la flota principal y se ubica en la órbita encima de las recuperadas tierras del Sur. Se reunen con Scott y él le informa al Concilio Plenipotenciario en Tirol los resultados de la Tercera Guerra Robotech y de la falla en la llegada del SDF-3. Scott Bernard es promovido al rango de Coronel. Varios mechas Robotech basados en la Protocultura dejan de funcionar en todo el cuadrante. Los transportes vuelven a utilizar los recursos químicos, los aviones de museo vuelven a entrar en uso. Scott Bernard y Vince y Jean Grant comienzan la búsqueda de la fortaleza extraviada a bordo del Ark Angel, la cual es la única nave espacial en funcionamiento debido a sus controladores de transposición de Sekiton. En Haydon IV, Veidt y Exedore están presentes en el redespertar del Conocedor del planeta. Max y su familia también están en el planeta. Cabell está en Tirol. El gran dios Haydon despierta en Haydon IV. Haydon IV deja su órbita planetaria, todos los habitantes son forzados a entrar en las cámaras bajo la superficie y son custodiados por los Haydonitas. El largamente esperado "Evento" (un evento cósmico que ha alterado la estructura del espacio-tiempo) ha comenzado; su inicio programa al Conocedor de Inteligencia Artificial de los planetas para la acción decretada por Haydon hace muchos eones atrás. Exedore y Veidt descubren que de alguna manera el universo ha empezado a colapsar. La nave de comando de la flota Karbarrana N'trpriz, intentando rescatar a los prisioneros que están bajo la superficie de Haydon IV, es borrada por su propia secuencia de autodestrucción armada por el Conocedor del planeta. Haydon IV ejecuta una transposición hiperespacial al sistema Ranaath, un sistema de agujero negro y el fin de la recepción del pulso de energía que acompañó a la partida de los Invid.
2036 El General Vince Grant y el Dr. Louie Nichols esperan encontrar al SDF-3 en el mismo lugar al que la Regis Invid voló después de transformarse en fénix y partir de la Tierra. La Teniente Nova Satori, ex integrante de la Policía Militar Global, dirige el Movimiento Homunculi. Scott regresa a la Tierra en busca de Marlene, esperando encontrar una pista de la ubicación de la Regis Invid. Después de una semana de investigar y preguntar, encuentra a Rand y a Rook embarazada en un pueblo cercano a Trenchtown llamado Xochil, donde Rand estaba escribiendo sus memorias. Desde ahí la caravana se dirige a Roca Negra, donde Scott encuentra a Marlene con Lunk. Annie ha vuelto al bosque selvático para vivir con Magruder. El viejo equipo de Scott se enfurece con él después de saber de los misiles de neutrones "S", pero lo perdonan. Ariel/Marlene aclara que su hermana Sera tiene un vínculo cercano con la Regis y Scott debiera consultar con ella.
2036 (cont.) El Ark Angel ejecuta exitosamente un salto transposicional de prueba al lado oscuro de la luna y se prepara para transposicionarse a Haydon IV donde esperan encontrar una dirección para la desaparición del SDF-3. Scott lleva a Marlene a Nueva York (antiguamente llamada Mannhatan) donde Sera está con Lancer. Sera profetiza un poco del futuro de Ariel, entonces con su último suspiro, ella muere y su cuerpo y espíritu vuelven para ser uno con la Reina Madre. Scott y Marlene son escoltados a Norriastown, donde Marlene es llevada para ser interrogada. Scott regresa al Ark Angel y con los Grants y los miembros del concilio, son informados por el Dr. Nichols que la razón de la falla de los mechas es que toda la Protocultura de 1rageneración de la matriz original de Zor en el SDF-1 y aquellas creadas por la Regis en la Tierra dejan de existir después de la huida de la Regis. Ellos comprenden que los sistemas de transposición y dirección a bordo del SDF-3 fueron tomados en su totalidad de la nave insignia original de Breetai, y la fortaleza de batalla podría haber sido afectada por la Regis cuando ella dejó la Tierra. El Dr. Nichols también les advierte que la partida de la Protocultura lleva a la Robotecnología a un final. Ahora los humanos y todos los alienígenas [sentient] deben definir sus propios destinos, uno que ellos moldearán por sí mismos y no por tecnología conducida por la Protocultura. Scott es reunido con Marlene y se le ordena intentar restablecer el vínculo entre ella y la Regis. El Ark Angel llega a la vecindad de Haydon IV pero el planeta ya no está ahí. Luego de subir a los sobrevivientes de la nave de mando N'trpriz, la nave entonces se transposiciona a Tirol para informar al Concilio Plenipotenciario de sus descubrimientos. Todas las caravanas se dirigen al sistema Ranaath y realizan los preparativos para el salto al sistema de agujero negro. Karbarra declara la guerra a Haydon IV. Haydon IV aparece en la órbita alrededor del sexto planeta en el sistema Ranaath y comienza a recolectar datos de la radiación proveniente del agujero negro. Haydon IV se reconfigura para iniciar la producción en naves para seguir la trayectoria de la Regis. Nuevo Espacio La llegada del SDF-3 al Nuevo Espacio: un universo de no-espacio construido por las Figuras de Protocultura y la Regis. Similar a la singularidad de los conductores de transposición del SDF-1 los cuales capturan un quantum del hiperespacio y los lleva dentro de un mundo de tiempo, el SDF-3 capturó un quantum de tiempo y lo ha llevado dentro del hiperespacio. El Nuevo Espacio está fuera de la región de espacio y tiempo. Los controladores de transposición del SDF-3 también han desaparecido, como había sucedido al SDF-1 después de su transposición inaugural. Una serie de experimentos y expediciones extra-vehiculares son hechas para probar las condiciones del "espacio" circundante. El Capitán Jack Baker es el primero en realizar la excursión. Rem aclara a la tripulación del SDF-3 que el "nuevo espacio" es un universo de hecho. Retirado del 15vo Escuadrón ATAC, el Cabo Bowie Grant está a bordo con las Musas. Ellos se esfuerzan para reemplazar a la hermana muerta del triunvirato con sintetizadores y samplers para recrear la música embelesadora que las hermanas tocaron alguna vez a bordo de la nave insignia de los Maestros. Minmei continúa su labor de cantante una vez más para tratar de despertar las memorias de Zor que posee Rem, de quien ella se ha enamorado. Combinados con los antiguos miembros del 15vo Escuadrón ATAC de la Cruz del Sur, los Capitanes Jack Baker y Marie Crystal dirigen dos escuadrones de Veritechs (entre ellos están: el Capitán Sean Phillips, el Sargento Angelo Dante y la Capitán Karen Penn) para interceptar los próximos "múltiples [bogeys] de tentáculos sin origen" que se acercan hacia el SDF-3. Los Cazas que son interceptados por los tentáculos desaparecen, y están "presuntamente desaparecidos". Partes vitales del sistema de control reflex de la nave desaparecen durante el ataque.
2037 El Ark Angel se transposiciona a Karbarra para intentar dominarlos desde la declaración de guerra en Haydon IV antes de ser informados de la situación en el planeta. Cabell informa a todos sobre la génesis de Haydon y su contribución a la evolución de los Invid, Karbarranos, Perytonianos, Spherisianos, Garudanos, Praxianos, y todas las razas del Grupo Local. Sobre el emparejamiento de los Invid y la protocultura y su transmutación (el Evento), la raza de Haydon saldría en animación suspendida, enganchado a la cola del fénix Invid y los siguen dentro de otra dimensión.
2037 (cont.) El Ark Angel aparece en el sistema Ranaath y ve a Haydon IV reconfigurado y unido a un planeta extrayendo metales para las naves que el planeta está fabricando. El cyber-equipo de Louie Nichols se comunica con el Conocedor del planeta para encontrar la traza del rumbo para las naves, así el Ark Angel puede llegar delante de las naves de Haydon. Las comunicaciones con Exedore y los Sterlings son establecidas. Con una falsa declaración de amor de Scott, Marlene tiene un contacto y confirma que la Regis está en la estrella colapsada de Ranaath. En instrucción de la localización del SDF-3, se realizan los preparativos para secuestrar una de las naves esferoide construidas nuevamente por Haydon después de que el Conocedor del planeta ha programado las coordenadas y trazado el curso dentro de los computadores automáticos para que las naves sigan la ruta del Invid dentro del agujero negro. La flota Karbarrana llega a la estrella de Ranaath y empieza a ocupar Haydon IV con sus tropas. Dana Sterling dirige una rebelión contra el Conocedor del planeta para liberar a sus prisioneros. El Coronel Scott Bernard dirige la misión para secuestrar la nave prototipo de Haydon. Louie y su cyber-equipo son infiltrados en la Inteligencia Artificial del planeta, tratando de dar claridad al equipo de Scott para tomar la nave sin que Haydon lo sepa, y esperando también derrocar al Conocedor del planeta en el desarreglo por los ataques múltiples coordinados. El Ark Angel despliega transbordadores a Haydon IV para recoger a los rehenes, incluyendo a Exedore, Veidt, y los Sterlings. Scott (con la ayuda de Louie y su cyber-equipo) secuestra exitosamente una nave Haydonita (bautizada como Peter Pan) y el Ark Angel carga con repuestos y tripulación (incluyendo a los Grants, el Doctor Penn, padre de Karen; Marlene, Louie y su cyber-equipo, y los Sterlings) para la nave. Ya completada, la nave continúa su programación y se embarca para el viaje dentro del agujero negro. Exedore y Cabell descubren un nuevo tipo de energía en el universo, la anti-Protocultura. Los Ancianos Robotech, habiendo viajado a través de las estrellas hasta haber quedado sin Protocultura, proveen a Haydon con la localización del nuevo tipo de Protocultura en Nuevo Praxis a cambio del dominio de los planetas del Grupo Local. Haydon está de acuerdo, pero ve que los planes de ellos han organizado una traición a él. El se transposiciona con Haydon IV a Nuevo Praxis.
2037 (cont.) El SDF-3 encuentra un planeta que el Dr. Lang Nuevo Espacio ha descubierto. La nave traza un curso para el planeta recientemente formado. Lisa está confundida por los extraños comportamientos de Roy (de 5 años de edad antes del Nuevo Espacio) y de los otros niños toman juntos en el SDF-3. Los niños hacen un modelo de Haydon IV y lo destruyen. Rem tiene recuerdos periódicos de la vida de su progenitor, el sembrado y experimentación con la Flor de la Vida, mientras Minmei continúa cantando con Bowie y las Musas. El SDF-3 llega a la órbita alrededor del planeta (bautizado como Omphalos). Rick acompaña al equipo de infantería para inspeccionar el planeta. Minmei le informa a Lisa que está esperando al hijo de Rem y le pregunta para consolar su miedo por el parto. Angelo y Gnea desaparecen del equipo de exploración, y tienen un momento romántico juntos antes de descubrir que la Regis los observaba. Kazianna Hesh dirige una formación de Quadronos y battlepods que descienden al planeta para ayudar al equipo de exploración, que busca a sus miembros extraviados. Roy, Drannin y sus compañeros forman un círculo en su guardería y empiezan a cantar "Aurora". Angelo y Gnea reaparecen luego de reunirse con la Regis Invid, y avisan al equipo de exploración que la Regis tiene los sistemas de transposición y que el universo conocido se acerca a su fin. La Regis está utilizando la ruptura que ella hizo en el agujero negro para succionar el antiguo universo hacia el nuevo espacio, creando un nuevo universo donde ella surja como un Dios. Rick es requerido en el SDF-3 debido a que los niños estaban en contacto con Aurora. Espacio Real Haydon IV llega a Nuevo Praxis y ordena a todos los Praxianos a llevarle todas las Flores de la Vida. A bordo del Peter Pan, Marlene recupera la conciencia y Aurora en invocada al SDF-3. Aurora informa a los niños del SDF-3 que la ayuda está en camino. En Tirol, Exedore y Cabell se reunen con los capitanes del Grupo Local para planificar el ataque a Haydon IV desplegado en Nuevo Praxis.
2037 (cont.) Haydon IV finaliza la transferencia de las Flores de la Vida sin procesar desde el planeta a cambio de una guardería infantil para las féminas Praxianas. Entonces Haydon IV realiza una transposición a la órbita de Tirol. La flota del Grupo Local llega con el Tracialle y el Valivarre liderando el ataque. Mientras la flota se acerca a Haydon IV, el planeta se transforma a una modalidad de batalla similar a la transformación del SDF-1. El Tracialle es destruido junto con Haydon IV, pero Haydon ha lanzado sus nuevas naves y la Conciencia del planeta flota de manera independiente hacia Tirol para conseguir la Matriz de Protocultura diseñada por Rem. Exedore a y Cabell se esfuerzan en coordinar la evacuación de Tirol hacia los refugios bajo la superficie. Tiresia es destruida mientras la Conciencia de Haydon IV consigue la Matriz. Toda las máquinas e información de la anti-Protocultura también son destruidas. Haydon energiza y transposiciona sus naves, una de ellas con los Ancianos Robotech en su interior, hacia la estrella de Ranaath. Con la Conciencia al mando de las naves esféricas, Haydon se separa en pequeñas unidades de "personas" para abordar las naves e ingresar al agujero negro. Las naves Haydonitas están diseñadas para auto-destruirse con la energía del viaje, dando a Haydon la energía suficiente para convertirse en un dios y crear su propio universo. Nuevo Espacio Rick, Lisa, Kazianna y los otros padres de los niños llegan a la guardería donde sus hijos salen finalmente del trance, informando a sus padres que la ayuda viene en camino. Luego de la breve explicación a Angelo y Gnea, el SDF-3 comprende que todas las creaciones con origen en la Protocultura dejarán de existir y que la Regis desea regresar a un estado de existencia similar al encontrado antes de Zor. Llegada del Peter Pan con Aurora guiando a la nave hacia el SDF-3. La tripulación de la RDF original se reune una vez más. Ante la insistencia de Rem y los niños, se constituye un grupo que regresará a Omphalos para intentar comunicarse con la Regis. Una patrulla de Alphas había descubierto una colmena Invid y el grupo es transportado a las proximidades de la colmena. El grupo incluye a los Hunters, los Sterlings, los Grants, Kazianna y Drannin, Rem y Minmei, el Dr. Nichols y su cyber-equipo, el Dr. Lang, Scott y Marlene, Angelo y Gnea, Baldan y Learna. El grupo se reune con la Regis y se enteran del ultimátum impuesto por ella. Max gana un combate contra un mecha negro elaborado por la Regis a partir del lado oscuro de los sentimientos de Dana debido a que sus padres la dejaban en la Tierra. Después de la batalla de Max, el grupo regresa al SDF-3 y el Dr. Lang y el Dr. Nichols son puestos bajo custodia, pero ambos escapan con la ayuda de los amigos cyberpunk de Nichols. La Regis y Haydon luchan por la supremacía. El Dr. Lang se fusiona con las Figuras de Protocultura, con el Dr. Nichols como la última persona en ver al Dr. Lang una vez más. Luego de regresar al SDF-3, el grupo se dirige a la sala de máquinas con la esperanza de que los niños del SDF-3 puedan de algún modo traer de vuelta el sistema de transposición para salir del Nuevo Espacio mientras la Regis está preocupada. Con la ayuda de Aurora y de la voz de Minmei, los niños del SDF-3 teletransportan el sistema de transposición original del SDF-1 de los dominios de la Regis y es rápidamente ajustado a los sistemas del SDF-3. El SDF-3 ejecuta una transposición al espacio real. En el umbral entre el espacio real y el Nuevo Espacio, la Regis y Haydon chocan de frente (la Intersección, el fin de las Figuras). Ambos, ya próximos a alcanzar el estado de dioses, conocen de una vez por todas el verdadero significado de la humildad y las sensaciones precedidas de aceptación, resignación y paz. La Regis toma nuevamente la forma de fénix y se dirige hacia su hora final. Todo atraviesa al SDF-3, la tripulación mira a través del tiempo y el espacio y de los lugares y personas del pasado. Kazianna tiene visiones de Breetai y Drannin ve por vez primera a su padre; Lisa tiene visiones de su gran amor perdido, Carl Riber, incluyendo otras de Claudia Grant, la tripulación del puente, y el Capitán Gloval; Rick tiene visiones de Ben Dixon, Claudia Grant, el viejo circo del aire de su padre, Roy Fokker y de él mismo creciendo mientras Roy II observa desde los brazos de Rick; Dana tiene visiones de sus tres padrinos en la Tierra y de la atormentada vida de Zor, y lo entiende; Bowie tiene visiones de su viejo amigo Rolf Emerson; Scott tiene visiones de Marlene y Ariel interduplicadas; Ariel/Marlene tiene escenas de los momentos de la vida de la Marlene original y del esfuerzo de su propia raza por sobrevivir en Optera; y Minmei tiene visiones de su primo Kyle, sus padres, su amante Jonathan Wolff, y de su amiga y compañera, Janice Em. Después de la Intersección, Haydon alcanza al SDF-3 (aún en el espacio de la transposición) y encuentra lo necesario para asegurarse de que la Protocultura no repetirá los mismos sucesos en el espacio real. Rem y Minmei desaparecen de la nave y se les denomina como "presuntamente extraviados". Los conductores de transposición del SDF-3 también son tomados, pero la misma nave se transposiciona de manera exitosa. Los miembros extraviados de los escuadrones Veritech Azul y Rojo son regresados al SDF-3.
2038-2051 El regreso del Ark Angel a la Tierra. La nueva tecnología de las naves ayuda a reconstruir el planeta. El agua y el hielo son traidos de otros lugares para reemplazar las aguas contaminadas de la Tierra. Las naves espaciales son construidas con nuevos diseños y los mundos del Grupo Local ayudan a la Tierra a volver a ponerse de pie. Ellos no son conscientes de que la Intersección ha sucedido y la tripulación del SDF-3 se presume muerta. La transposición y la tecnología sin el uso de la Protocultura se hacen posibles. La erradicación del viejo gobierno de la Tierra, y el inicio de un gobierno benigno, democrático y participativo, el cual desea olvidar a la REF. Los Haydonitas sobrevivientes se transforman en los Cuerpos de Paz Interestelar. Maria Bartley-Rand es dada a luz por Rook en el 2037. Exito del libro de Rand - Notas en el Viaje.