Nacido en Sabadell, llegó al fútbol base del Barça en verano de 2005 procedente del Jabac. Aquella temporada, con el Juvenil A, logró el triplete con un equipo en el que también estaban Bojan, Giovani, Jeffren o Marc Crosas entre otros. La temporada 2006-07, Sergio Busquets siguió en el Juvenil A y fue uno de los pilares del equipo de Àlex Garcia. Como juvenil de tercer año, a pesar de jugar de mediocentro Sergio marcó 7 goles en 26 partidos jugados.