ID -tutkimuksia
T�lle sivulle olen koonnut ID -teoreetikkojen "peer rewiew" -l�p�isseit� kokeita. Olen pyrkinyt liit�m��n mukaan linkkej� itse kokeisiin sek� mahdollisesti n�iden kritiikkej�, sek� joitain tulkintoja. Huomiona voisi sanoa, ett� tutkimukset ovat hyvi�. Ne vain eiv�t tutki Suunnittelijaa, Suunnittelua eiv�tk� tuo n�ihin kahteen valoa. Evoluutiota, universumin synty� ja biogeneesi� ne kuitenkin k�sittelev�t. Tutkimusty�, etenkin kriittinen, on aina hyv�ksi tutkimusalalle kuin tutkimusalalle. Varmasti kaikki kuitenkin ymm�rt�v�t, ettei evoluutioteorian kritisoiminen, darwinismin ja natsismin yhdist�minen, koululautakuntien haastattelemana oleminen, oikeussaleissa ravaaminen tai kansalle suunnattujen kirjojen kirjoittaminen, k��nt�minen ja myyminen ole ID-tutkimusta.En ole listannut t�h�n kaikkia artikkeleja, joita ID:l�iset v�itt�v�t tukevan heid�n n�kemyksi��n, siis sellaisia kuin esimerkiksi t�m�.
D. Axe:
"Estimating the Prevalence of Protein Sequences Adopting Functional Enzyme Folds", 2004, Journal of Molecular Biology
***, ***
Tutkimus kertoo, ett� mahdollisuus sille, ett� tietynlaisella toiminnallisella ytimell� toimivan proteiinin syntymahdollisuus on v�lill� 1:10^77 - 1:10^53
T�m� on vain murto -osa Dembskin "design filtterin" vaatimasta kompleksisuudesta. Yleens� kreationistit mainitsevat vain pienimm�n luvun, eli 1:10^77. "Amplitudi", joka on per�ti 24 "kymppipotenssin" suuruinen, j�� tyypillisesti my�s mainitsematta. Samoin se, ett� oikea proteiinien variointiraja on paljon suurempi, kuin pelkk� tietyn toiminnallisen ytimen variointiraja, jolloin p��telm�� "isolaatiosta toiminnallisten yksik�iden avaruudessa" ei voida tehd� - varsinkaan, kun Axen tutkimus ei kerro siit� painottuvatko toiminnalliset yksik�t avaruudessa tasaisesti vai eiv�tk�. Samoin mainitsematta j�� se, ett� Axe itse on ollut sit� mielt�, ett� h�nen tutkimuksellaan ei ole merkityst� "intelligent designille".
M.J. Behe and D.W. Snoke:
"Simulating Evolution by Gene Duplication of Protein Features That Require Multiple Amino Acid Residues",Protein Science, 13, 2004 ss. 2651-2664.
Tutkimuksessa esitet��n algoritminen evoluutiomalli koskien haploidisia ja eirekombinoivia eli�it� (enemmist� eukaryooteista on kuitenkin diploidisia ja seksuaalisia) Behe p��ttelee ett� evoluutio on liian hidas, jotta mutaatiot voisivat tehokkaasti tuottaa uudenlaista toimintaa.
Tutkimus kertoo, ett� jos sinulla on proteiinifunktio, joka vaatii kaksi tai useamman spesifin mutaation tiettyyn paikkaan tietyss� geeniss� ja tietyss� populaatiossa ja jos funktio ei omaa toiminnallisia v�limuotoja joihin luonnonvalinta voisi vaikuttaa, ja jos ainut mutaation muoto on pistemutaatio ja jos populaatio ei lis��nny seksuaalisesti, tarvitaan pitk� aika ja suuri populaatio jotta evoluutio voisi kehitt�� funktion. T�m� ei ole odottamatonta. Tutkimus ei sen sijaan esit� ainuttakaan vaihtoehtoista selitysmallia tai syntymekanismia eik� empiirist� tapaa mitata sit�.
My�s tutkimuksen arvo l�ytyy suoraan tutkimuksen omista johtop��t�ksist�:
"We strongly emphasize that results bearing on the efficiency of this one pathway as a conduit for Darwinian evolution say little or nothing about the efficiency of other possible pathways. Thus, for example, the present study that examines the evolution of MR protein features by point mutation in duplicate genes does not indicate whether evolution of such features by other processes (such as recombination or insertion/deletion mutations) would be more or less efficient."
***
D.K.Y. Chiu & T.H. Lui: "Integrated Use of Multiple Interdependent Patterns for Biomolecular Sequence Analysis",International Journal of Fuzzy Systems, 4(3) 9/2002, ss. 766-775.
Craig, W.L:
"Barrow and Tipler on the Anthropic Principle vs. Divine Design.",British Journal for the Philosophy of Science 38, 389-395.
M.J. Denton, P.K. Dearden, S.J. Sowerby:"Physical law not natural selection as the major determinant of biological complexity in the subcellular realm: new support for the pre-Darwinian conception of evolution by natural law.",Biosystems. 2003 Oct;71(3):297-303.
M.J. Denton, J.C. Marshall & M. Legge:"The Protein Folds as Platonic Forms: New Support for the pre-Darwinian Conception of Evolution by Natural Law",Journal of Theoretical Biology 219, 2002, ss. 325-342.
Matti Leisola & Ossi Turunen:"Protein engineering:opportunities and challenges", Applied Microbiology and Biotechnology vol. 75. 6 July / 2007
Artikkeli k�sitteli sit� miten ihmiset tuottavat proteiineja laboratoriossa.
Ja darwinistiseen metodiin kuuluvat keinot voivat vaihtua rationaalisiin metodeihin kunhan saadaan tarkempaa tietoa miten sekvenssi ja proteiinin rakenne m��ritt�� rakenteen, muodon ja toiminnan. Artikkeli ei mainitse �lyk�st� suunnittelua. ***
Douglas D. Axe, Brendan W. Dixon, Philip Lu:"Stylus: A System for Evolutionary Experimentation Based on a Protein/Proteome Model with Non-Arbitrary Functional Constraints."
Kokeessa tutkittiin kiinalaisten merkkejen kehitt�mist� evolutiivisesti. Kyseess� ei siis ollut luonnon tutkiminen. T�m�n kuitenkin ajateltiin olevan analogian kautta sidoksissa luonnon evoluutioon. T�m� onkin kokeen suurin vika: Heid�n analogiansa kun vaatii toimiakseen ett� proteiiniavaruus on yht� ep�tasainen ja yht� ep�jatkuva ja yht� hajanainen kuin kiinalaisten merkkien. T�m� ei ole uskottavaa, koska proteiineilla tehtyjen kokeiden mukaan proteiinien toiminta vaihtuu verkostoissakin, eli usean eri proteiinin toimintakokonaisuudessa, eli biologiset verkostot ovat joustavia ja kaikkea muuta kuin ep�jatkuvia. Kysymys ei siis ole siit� voidaanko kiinalaisia merkkej� tuottaa vai ei, vaan siin�, miten t�m� kaikki muka automaattisesti sopii luonnon evoluutioon.
***
�. A. Voie:"Biological function and the genetic code are interdependent",Chaos, Solitons and Fractals, 2006, Vol 28(4), ss. 1000-1004.
***
Tulos:"Turingin koneita ei voida tehd� itseorganisoituvista materiaaleista."
*T�m� kertoo miksi evoluutioalgoritmit ovat toimivia ja voivat:Evoluutioalgoritmien ansiosta ei tarvitse osata luoda Turingin konetta, joka tuottaisi heti vastauksen.
*Yhdistettyn� Dembskin "displacement teoreemaan" (=informaation tuottamiseen tarvitaan enemm�n informaatiota kuin mit� tuotetaan) k�y niin, ett� satunnaismuutokset ovat valikoivia voimia uskottavampia Turingin koneiden kasaamisessa : Jotta "�lyk�s informaationvaihto" voisi koota Turingin koneen, t�m�n "valikoivan voiman" rakentaminen vaatisi enemm�n Suunnittelua kuin itse Turingin koneen suora ohjelmointi vaatisi.
->Jos ei tied� vastausta suoraan, kannattaa tehd� evoluutioalgoritmi. Evoluutioalgoritmi voi datamainata informaatiota enemm�n, kuin mit� olet sen hyvyysfunktioihin koodannut.
->Jos tiet�� vastauksen suoraan, kannattaa valmistaa kokonainen valmis vastaus.
Virheen� t�ss� kokeessa on se, ett� Voie k�ytt�� pohjimmiltaan staattista toimintasysteemi� pohjimmiltaan dynaamiseen systeemiin, kuten evoluutioon, jossa evoluutiossa olevat eli�t muuttavat my�s taustalla olevaa "hyvyysfunktiota" saalistamalla ja kuluttamalla ravintoa sek� eritt�m�ll� erilaisia orgaanisia aineita.
T�m� heikent�� h�nen argumenttiaan. Voie ei my�sk��n mainitse "�lykkyytt�" miss��n osassa teksti��n. K�yt�nn�ss� t�m�n kannanoton Voien argumenttin kumoaa se, ett� itsereplikaatiota on aikaansaatu laboratorioissakin:. Esimerkiksi kuuluisissa Manfred Eigenin kokeissa vuosimallia 1974.
Matemaattinen malli, joka ei sovi havaintoihin on k�yt�nn�ss� ep�tarkka, virheellinen tai irrelevantti. Spekulatiivinen filosofia ei koskaan jyr�� havaintojen yli.
Mohamad Warda, Jin Han, "Mitochondria, the missing link between body and soul: Proteomic prospective evidence."
Tutkimus ei ollut normaali tutkimus, jossa tehtiin tutkimus ja kuvattiin sit�. Sen sijaan siin� koostettiin yhteen muiden tuloksia. Se yritti kumota endosymbioositeorian. Se liitti mitokondriaan ad hoc -liiteen� my�s anonyymin "Mighty Creatorin"; Pohjimmiltaan vain v�itt�m�ll� ett� on fiksumpaa hyl�t� fylogeniasta johtuva syy sille miksi mitokondrioita l�ytyy soluista ja vain ajatella ett� t�m� on liitt�nyt sen erilaisiin soluihin. Artikkelissa oli plagiointia ja t�m�n lis�ksi siit� l�ydettiin my�s valtavasti virheit�; Se koostui l�hinn� savuverhon rakentamisesta ; Perustelun kannalta irrelevantteja asioita mitokondrioista vain lueteltiin. T�m�n vuoksi Proteomics -lehden jossa se julkaistiin "editor-in-chief" Michael Dunn kiisti p��asiassa plagioinnin vuoksi t�ysin arvioinnin arvon ja peruutti sen, ja se poistettiin mm. lehden julkaisuista. K�sittelyn alla olevaa tutkimusta voi siis sanoa ex-peer rewiew -koosteeksi. T�m�n tutkimuksen varrella tehty plagiointi on kuitenkin hyv� esimerkki kreationistien moraalista, jolla he ovat mukana peliss��n.
Katso my�s:
Stephen Matheson, "Do ID theorists generate data?",2007