Con anterioridad a 1955 la entonces Base de Submarinos (actual asiento del Comando de la Fuerza Submarinos y de la Base Naval Mar del Plata), cubr�a la seguridad de la misma, entre otros, con una Compa��a de Vigilancia y Seguridad integrada por efectivos de Infanter�a de Marina. De esta Compa��a se desprenden efectivos, naciendo el 19 de enero del a�o 1955 la Compa��a de Infanter�a de Marina N� 7.
En 1959serealizan los primeros cursos de buceo y un a�o despu�s (1960) su personal adquiere tambi�n la capacitaci�n de paracaidistas, especializaciones necesarias para desarrollar actividades de reconocimiento anfibio. La unidad va cambiando de denominaci�n junto con la incorporaci�n de nuevas t�cnicas y t�cticas a desarrollar en la guerra anfibia.
En el a�o 1966, por disposici�n del comando de Operaciones Navales N� 5/66 publicada en bolet�n Naval �C� N� 8/66 toma el nombre de Compa��a de Exploraci�n y Reconocimiento Anfibio, con la incorporaci�n de veh�culos de exploraci�n livianos, asumiendo la responsabilidad de proporcionar alas Fuerzas del Cuerpo la exploraci�n de combate y los reconocimientos de playas de la zonas costeras.
En el a�o 1970 se desdoblan estas actividades cre�ndose la Compa��a de Exploraci�n, tomando el nombre de Compa��a de Reconocimiento Anfibio. En el a�o 1974 recibe su actual denominaci�n de �Agrupaci�n de Comandos Anfibios�.
Desde su creaci�n, esta unidad tuvo como actividad principal la de brindar informaci�n a las Fuerzas y/o Unidades de Infanter�a de Marina sobre las posibles playas de Desembarco, sus condiciones hidrogr�ficas, caracter�sticas de las defensas enemigas y del terreno interior, as� como tambi�n de las zonas aptas para aterrizaje de helic�pteros.
La Agrupaci�n cumple adem�s de las actividades de una Unidad Escuela ya que debe capacitar al personal de Comandos Anfibios que posteriormente deben nutrir las fracciones operativas de la misma.
Est� adiestrada adem�s para el despojamiento de obst�culos naturales en las zonas de playas y a realizar incursiones o cumplir misiones especiales en apoyo de las operaciones que se est�n llevando a cabo.
Otra de las capacidades que singulariza a esta Agrupaci�n es su adiestramiento altamente especializado, dotada de una gran variedad de armas y equipos especiales, con capacidad de operar un tiempo limitado en forma totalmente independiente y con aptitud para cumplir una amplia y diferente gama de misiones en todo tipo de terreno y condiciones meteorol�gicas.
En el a�o 1982 la Agrupaci�n tuvo una destacada actuaci�n al intervenir en la reconquista de las Islas Malvinas y las acciones b�licas posteriores al 2 de abril de dicho a�o, recibiendo distinciones tanto a nivel Agrupaci�n como por el accionar individual del personal de Comandos Anfibios que permanecieron durante todo el desarrollo del conflicto, recibiendo condecoraciones por su desempe�o en variadas misiones de combate.
Desde sus or�genes la agrupaci�n de Comandos Anfibios tiene su asiento en la actual Base Naval Mar del Plata.
El primer hombre en perder la vida en cumplimiento del deber en Malvinas fue un integrante de este cuerpo el Capit�n de Corbeta Pedro Edgardo Giachino.