Según reza en todos los libros de historia de los escolares del año 2015, el dia 13 de Septiembre del año 2000 un meteorito pasó peligrosamente y a gran velocidad cerca del polo sur.

El resultado fue la peor catástrofe conocida por la humanidad hasta el momento. el aumento de calor hizo que el Polo sur se derritiera y el nivel de todos los mares y océanos subió sesenta metros sumergiendo y arrastrando todas las ciudades costeras.

La temperatura y morfología de la tierra cambio bruscamente causando sequías, inundaciones, lluvias y toda clase de desastres naturales. Debido a la crisis y a sus devastadores efectos sobre el planeta, más de la mitad de la población terrestre murió.

La hecatombe se denomino "Second Impact" (Segundo Impacto) en referencia a la extinción de los dinosaurios cuando impacto un meteorito millones de años antes.

(Pero en realidad detrás del choque se encuentran unos seres llamados ángeles, cuyos verdaderos propósitos son totalmente desconocidos. )   

Año 2015 Quince años después de la catástrofe. Tokio-3, una nueva ciudad reconstruida en el área de Hokone, en el interior de Japón,sustituye a la antigua ciudad de "Tokio" que quedo total mente sumergida tras el Second Impact. Súbitamente aparece un extraño y gigantesco ser. Sus intenciones y orígenes son completamente desconocidos y su poder parece ilimitado. Todo el país esta amenazado por este monstruo que parece imparable.

Pero entonces hace su entrada una organización secreta llamada. NERV. Dirigida por el sombrío y misterioso Gendou Ikari, NERV dispone de un prototipo de arma secreta capaz de enfrentarse a este ser al que todos llaman Angel. Dicha arma son las unidades Evangelion un tipo de gigantesco robot humanoide construido con las más avanzadas técnicas de bioingeniería genética y mecánica.

Pero existe un problema la unidad Evangelion sólo puede ser pilotada por niños de catorce años y de unas características muy determinadas. Y para hacer frente al ángel hace falta un piloto. El elegido es Shinji Ikari, de catorce años, el propio hijo de Gendou; un chico deprimido y solitario al que cualquier cosa apetecería más que subirse a un robot gigante para enfrentarse al monstruo. El primer gran conflicto de una larga serie de revelaciones a niveles externos e internos esta apunto de desatarse. y no sera el último.

Así comienza un de esas series que marcan época que antes de que terminen de emitirse en Tv ya son clásicos y que han causado primero en Japón y luego el resto del mundo(Aunque en menor escala)un auténtico fenómeno social como hacia años no se veía. Puede decirse que Neon Genesis Evangelion es sin lugar a dudas una de las series de anime más populares de la década de los noventa.