Junto al grado de displacía de cadera y al tipo de dentadura, el color de los ojos constituye uno de los criterios de selección morfológica mas valorados entre los depositarios de la raza, de tal manera que en los pedigrees de algunos países extranjeros, estos tres rasgos aparecen clasificados junto al nombre de cada ejemplar.

El standard de la raza señala claramente para el Boxer unos ojos oscuros. Es importante cuidar este punto en caso de querer reproducir con nuestro perro o perra, si presenta un problema de ojos claros, buscándole una pareja con los ojos muy oscuros, para no caer en el riesgo de perpetuar este defecto tan importante para la correcta expresión de nuestra raza.

Aunque caben múltiples matices en este sentido, podríamos considerar unos ojos como claros de forma categórica (que no por ello excluyente) a partir de la clasificación 3A.