În afara de rolul lor în formarea proteinelor , anumiti aminoacizi îndeplinesc în organismul animal unele functiuni fiziologice specifice sau sunt precursori ai unor compusi cu rol esential în functionarea organismului. Glicocolul este precursor al sarcosinei (N-metilglicocol) si al creatinei (guanidino-sarcosina) , care sub forma fosfatului , fosfocreatina sau acidului creatinfosforic , constituie rezerve de energie ale organismului.

Energia necesara contractiei muschiulare este furnizata de acidul adenosintrifosforic (ATP) care trece în ADP si fosfat anorganic , proces catalizat de miosina . Refacerea acidului adenosintrifosforic din ADP si fosfat anorganic se face pe socoteala energiei furnizate de glicoliza . Acest proces fiind lent , într-un muschi suprasolicitat , refacerea ATP-ului necesar unei noi contractii muschiulare se face pe socoteala acidului creatinfosforic care cedeaza restul de fosfat bogat în energie acidului adenosindifosforic , trecând în creatinina , care se elimina prin urina.

Acizii asparagic si glutamic iau parte la reactiile de transaminare .

Ornitina si arginina (guanidino-ornitina) au un rol important în eliminarea amoniacului provenit prin degradarea aminoacizilor , sub forma de uree în organismul animal .

Sinteza ureei are loc în ficat . Ornitina fixeaza NH₃ si CO₂ , enzimatic , dând citrulina care cu o noua molecula de NH₃ trece în arginina. Arginina este apoi hidrolizata de arginaza în uree si cruitina .

Tirosina este precursorul tiroxinei (tetraiod- derivatul eterului p -hidroxifenilic al tirosinei) .

Tiroxina este un hormon care se gaseste în glanda tiroida , alaturi de diiodtirosina .

Iodul din alimente este fixat în glanda tiroida care contine un sistem enzimatic capabil sa oxideze ioni de iod la iod elementar . Lipsa iodului în organismul animal duce la o scadere a facultatilor mintale (cretinism) ; excesul de iod provoaca o crestere a arderilor în organism (boala lui Basedow) .