Es la saga en la que los protagonistas de la serie Naruto ya se an echo mayores ya que an pasado 2 años. En el comienzo de la temporada Shippuuden, es quando Naruto vuelve de su entrenmiento con el sannin Jiraya. En esta temporada se dara mayor importancia los Jinchurukis(criaturas como el zorro) i a la organización Akatsuki i por supuesto a Orochimaru i su aprendiz Sasuke. Apareceran todos los personajes que ya haviamos visto en la primera temporada pero un poco mas mayores i mas experimentados en tecnicas ninja. Tambien abra la aparicion de un nuevo compañero de equipo de naruto i sakura, substituyendo a sasuke, este nuevo ninja es llamado Sai.