La historia gira alrededor de un gato llamado en un principio Tom, quien tiene la capacidad de hablar y caminar en dos patas, y vive con sus dos hermanos (Jerry y Mary) en una casa en la campiña japonesa con un anciano (el abuelo) y la esposa de éste. Sin embargo el abuelo le ha aconsejado a Tom que no hable con otras personas ajenas a ellos. Tras la muerte del abuelo, Tom llora expresivamente en su funeral, lo que hace pensar a la gente que es un gato endemoniado. Así, Tom se separa de sus hermanos y empieza a recorrer las cercanías, hasta llegar a una ciudad. En esta ciudad vive un niño, estudiante de quinto grado que se llama Tom Kusanagi, quien, al recorrer por un camino con sus amigos, se encuentra al gato, que lo sigue hasta su casa y le agrada mucho a su madre (Kikuko Kusanagi). El padre de Tom, (Sr. Kusanagi) se pregunta si deben conservar al gato, y ante la insistencia de Tom y su madre lo acepta. En adelante, el gato Tom fué llamado Mikan. Mikan, hasta este momento, no ha manifestado ni a Tom ni a sus padres sus cualidades, salvo en alguna ocasión que Tom ha creido escuchar reir a Mikan, pero cree que es su imaginación.

Sin embargo, Mikán es un gran bebedor, y durante las noches baja a la cocina a beber el vino de la familia; una noche Tom decide espiarlo y le descubre ebrio, parado en dos patas y hablando. Mikan acepta el hecho de que Tom lo escuche, pero rechaza que lo hagan sus padres. Al poco tiempo Tom convence a Mikan que hable con sus padres.

En adelante, la historia tratará las aventuras de Mikan y Tom principalmente, pero siempre bajo la tónica de que no se descubra a Mikan hablando con los humanos. Mikan gusta mucho de tocar la armónica, pero lo hace de forma desagradable. Además aprendió a escribir, y presiona a Tom a ayudarle en sus tareas, inclusive un día se va a la escuela a escondidas.

Mikán más tarde tendrá un hijo, llamado Koringo, quien sólo balbucea algunas palabras. Todos los personajes que mas adelante menciono aparecen constantemente en el anime, pero, obviamente existen otros muchos personajes secundarios.

En México el anime termina en la vuelta de Mikan a la casa del abuelo y la visita que él hace a éste, diciéndole que ahora es muy, muy feliz.